В стенах Вознесенского монастыря, как и в соседнем Чудовом, вершили суд и расправу по церковным делам. Так, в 1610-е годы, при Михаиле Федоровиче, в кельях его матери, Великой инокини Марфы Иоанновны, допрашивали и признали виновным архимандрита Троице-Сергиева монастыря Дионисия, обвиненного в допущении ереси при исправлении богослужебных книг.
Вознесенский монастырь традиционно пользовался особым вниманием царской семьи: сюда, как и в Чудов, совершались вплоть до Петра I торжественные царские выходы. Путешественник второй половины XVII века Мейерберг описал и даже зарисовал, «каким образом царица по сокрытой галерее из дворца ежедневно шествует в женский монастырь Вознесения Господня для слушания там молитвы». Цари и царицы неизменно посещали монастырскую царственную усыпальницу в родительские субботы, а на Пасху, подобно тысячам своих подданных, клали на родительские могилы красные яйца. В Прощеное воскресенье царь с царицей приезжали в Вознесенский монастырь просить прощения у монахинь.
Сын Антиохийского патриарха Макария, архидьякон Павел Алеппский, вспоминал: «Царь (Алексей Михайлович. —
Разумеется, часто посещали Вознесенский монастырь царицы и царевны; в такие дни Кремль обычно запирали и не впускали посторонних.
В средневековом Кремле был установлен ежегодный крестный ход из Успенского собора в Вознесенский монастырь; иные крестные ходы, проходившие мимо обители, обязательно останавливались у ее ворот, и тогда для поклонения из монастырского собора выносили икону Богоматери Одигитрии.
В повседневной жизни Вознесенский монастырь обслуживал также бытовые и хозяйственные потребности женской половины царского дворца. Как явствует из старинных описаний, царевны занимали у кремлевской обители в долг или закладывали в нее свои драгоценности; инокини обшивали цариц и царевен и готовили для них лакомства. В день Вознесения из царского дворца посылали игуменье с сестрами рыбу, пироги и мед.
Вознесенский монастырь был одной из самых богатых и многолюдных обителей России. В XVII столетии, например, число его стариц превышало 100 (моровое поветрие 1654 года унесло жизни 90 вознесенских монахинь, в живых осталось 38), в 1674-м инокинь было 161, в XVII веке их число доходило до 200, в XIX — до 300. В 1699 году монастырь владел 2128 вотчинными дворами; до 1764 года монастырю принадлежали более 15 500 душ крестьян. В 1706–1710 годах ежегодные монастырские доходы, не считая оброчного хлеба и барщинной пашни его крепостных, составляли 3270 рублей; на содержание монастыря было определено 1984 рубля, остальное поступало в казну. В начале 1760-х годов ежегодное монастырское «жалованье» от казны составляло свыше 1500 рублей.
Богатство, как всегда, доставляло и хлопоты — известен факт привлечения игуменьи Вознесенского монастыря к суду за растрату в 1730-е годы. Более года, пока игуменья Евсталия подвергалась допросам в Петербурге, монастырем руководили «внешние управляющие» — капитаны Семеновского полка Ланской и Ладыгин. Вознесенские монахини становились и персонажами следствий по религиозным мотивам — например, в начале XVIII века, когда сектант Иван Тимофеевич распространил в московских женских обителях хлыстовское учение, а в кремлевском монастыре в 1718 году нашла приют беглая хлыстовка из Горицкого монастыря Марья Босая.
План Вознесенского монастыря. 1875 год. В центре участка — старинный Вознесенский собор.
Владел монастырь вотчинами и дворами в разных уездах — Московском, Боровском, Владимирском, имел подворья и огороды в Москве, в Зарядье, в Хамовниках и на Старой Басманной. Земли и села часто жертвовали в монастырь цари в память об умерших женах — например, Михаил Федорович пожертвовал в 1632 году Вознесенской обители село Ставрово (Владимирской области) в вечное поминовение царицы Пелагеи, «во иноцех Параскевы». Царскими дарами славилась монастырская ризница — золотые кресты Михаила Федоровича, золотые сосуды Алексея Михайловича. Знатные старицы Вознесенского монастыря и сами владели селами и, будучи инокинями, совершали имущественные сделки.