Святой Стефан родился около 1340 года в городе Устюге Вологодской губернии. Отец его Симеон был пономарем при тамошней соборной церкви. С молодых лет проявилось в Стефане святое желание послужить обращению к вере Христовой язычников-зырян, которых он часто встречал в своем городе. Для приготовления к столь важному делу Стефан поступил в Ростовский монастырь святого Григория Богослова, богатый книгами. Здесь подвизался в посте и молитве и вместе с тем изучал Священное Писание и греческий язык; составил зырянскую азбуку, перевел на зырянский язык необходимейшие церковные книги и с ними в 1378 году явился к Коломенскому епископу Герасиму, управлявшему митрополией по смерти святого Алексия. Епископ усмотрел в желании Стефана волю Божию, посвятил его в сан священника, снабдил святым миром, священными антиминсами и с молитвой отпустил на апостольский подвиг. Призвав Бога на помощь, святой Стефан начал благовествовать зырянам о едином истинном Боге и единой спасительной вере. Простодушные язычники слушали его дивную и неслыханную речь, и одни сразу полюбили нового учителя, часто беседовали с ним и принимали Святое Крещение; другие, напротив, сделались его врагами, оскорбляли его и отвлекали желавших от крещения. Нередко сама жизнь святого Стефана подвергалась опасности – в одно время вооруженные язычники окружили его со всех сторон и хотели убить, в другое время обложили его дом соломой и хотели сжечь его вместе с домом. Особенно упорного и опасного противника встретил святой Стефан в лице начальника волхвов, Пама, или Пана. Своим влиянием он удерживал язычников от Крещения, новокрещеных старался возвратить в язычество. Много раз Стефан вступал с ним в споры, продолжавшиеся целые дни и ночи, но не мог обратить его на путь истины. Наконец Пам предложил святому Стефану для доказательства истинности веры каждого пройти обоим сквозь огонь, а потом спуститься в одну прорубь и в другую выплыть. Он никак не ожидал, что Стефан решится на такой опасный опыт, но святой проповедник велел зажечь один отдельно стоявший дом, взял Пама за руку и безбоязненно повел в огонь. Хвастливый волхв пал в ноги святому Стефану и умолял его избавить от верной смерти. Точно так же отказался он спуститься в реку. Тогда народ бросился на посрамленного волхва и хотел убить его, но святой Стефан защитил своего противника и только велел ему удалиться в другую сторону и не совращать с пути истины новообращенных христиан. «Христос послал меня учить, а не убивать людей. Когда Пам не хочет спасительной веры Христовой, то пусть Бог его накажет, а не я», – сказал святой Стефан.
Такое кроткое, любвеобильное отношение даже к своим противникам сильно расположило зырян к святому Стефану, они постепенно оставляли язычество и принимали Святое Крещение. Когда число христиан умножилось, святой Стефан построил для них при слиянии реки Вымь с Вычегдой первый храм во имя Благовещения Пресвятой Богородицы – с той мыслью, что как Благовещение есть начало нашего спасения, так и церковь эта есть начало обращения земли Пермской. При этом храме святой Стефан поселился и отсюда путешествовал во все концы Пермской земли для обращения язычников. Во время этих путешествий святой Стефан обратил внимание на одну громадную березу, которую зыряне почитали святыней, срубил ее и сжег, а на ее месте построил храм во имя святого Архистратига Михаила, победителя злых духов. При этом храме святой Стефан устроил училище и в нем учил новообращенных изобретенной им пермской грамоте. Более способных предназначил – одних в священники, других в чтецы и с ними проник в самые глухие и отдаленные места. Немедленно после Крещения жителей какого-либо селения святой Стефан разрушал капища, сжигал идолов, а на месте их воздвигал храмы или часовни. Идолы обыкновенно обвешаны были шкурами дорогих зверей – лисиц, бобров и других. Святой Стефан сжигал их вместе с идолами. Язычники дивились этому и говорили: «Истинно он человек Божий и пришел к нам не для своей выгоды, а для нашего спасения», – и крестились.
Скоро число новокрещеных увеличилось настолько, что святой Стефан один не мог удовлетворять все духовные их нужды. И вот через четыре года он пришел в Москву просить особого епископа для новопосвященной паствы. Собор епископов избрал самого Стефана в этот сан, так как Стефан лучше других знал их язык, сам обращал их к вере. Великий князь Димитрий с радостью согласился на это избрание, и святой Стефан был посвящен в епископа в начале 1383 года. Щедро одаренный от великого князя и христолюбивых христиан, святой Стефан поспешил к своим новым христианам и основал свое постоянное местопребывание на Усть-Выме, при храме Благовещения. Вместе с сугубой благодатью святой Стефан усугубил свои апостольские подвиги. Всюду разыскивал язычников и увещевал их обратиться к вере Христовой, обращенных учил правилам веры и христианской жизни, строил храмы и посвящал в них священников, диаконов и чтецов, которые совершали богослужение на пермском языке.