Тем не менее конституционное положение было неясным. В одном недавно завоеванном государстве – эмирате Гранада – Фердинанд и Изабелла осуществляли контроль за церковными делами в гораздо большей степени, чем римский папа обычно был готов уступить, гораздо больший, чем они имели, например, в Арагоне или Кастилии. Однако они осуществляли его на основании особого законодательного акта – знаменитой буллы о Гранаде Orthodoxe fidei propagationem от 1486 года, которая давала им право представлять кандидатов на церковные должности во всех епископальных епархиях, монастырях и церквах в этом завоеванном государстве мавров. Для Индий такого законодательного акта не было. В основополагающей булле Inter caetera не было упоминаний о праве представления кандидатов на церковные должности, но в своих действиях в Индиях монархи, очевидно, брали на себя подразумеваемую в общих положениях этой буллы прерогативу, аналогичную той, которой они, бесспорно, обладали в Гранаде. Александр VI не чинил препятствий. На протяжении всего времени, в течение которого он занимал трон понтифика, он был чрезвычайно сговорчивым и откликался на просьбы и предложения испанцев, а в тот начальный период завоевания Индий их масштаб был очень незначительным. Однако завоевания в Индиях ширились, и преемник Александра VI Юлий II, чей характер Пастор[59] сравнил с характером Кортеса, оказался, несмотря на свое восхищение Изабеллой, менее уступчивым. В 1504 году испанские монархи впервые попросили, чтобы был принят папский закон о создании епископальных епархий в Новом Свете. В 1504 году Юлий ответил буллой Illius fulciti presidio, предусматривающей создание трех новых епископств, но в формулировке, которая полностью игнорировала притязания королей на право назначать на церковные должности.
Булла Illius fulciti presidio предала этот вопрос гласности и убедила монархов в необходимости дарования права назначения на должности в Индиях. Действие буллы было отсрочено из-за смерти Изабеллы вскоре после ее обнародования, сложных отношений Фердинанда с Филиппом Бургундским и кастильской знатью и его отъезда в Неаполь. Однако на протяжении этих непростых лет Фердинанд через своего посла в Риме продолжал оказывать дипломатическое давление на папу римского, которого к уступчивости подталкивала необходимость получить поддержку Фердинанда против французского короля Людовика XII. В 1508 году Фердинанд, который крепко держал в руках власть регента в Кастилии и контролировал все, что происходило в Индиях, получил все, к чему стремился. В том же году булла Universalis ecclesiae regimini передала навечно правителям Кастилии привилегию основывать и создавать все церкви и представлять кандидатов на духовные должности во всех епархиях и приходах на всех заморских территориях, которыми они владели на тот момент или могли обрести в будущем. Это знаменитое постановление было законным основанием королевского Patronato (попечительство) над Индиями. За этой буллой в 1510 и 1511 годах последовали буллы, регламентирующие нюансы, связанные с десятиной, взимать которую корона имела законное право, освобождающие производство драгоценных металлов от обязанности платить десятину, признающие Севилью центральной церковью Индий и заново проводящие границы первых епархий в соответствии с королевскими пожеланиями включить в них новые поселения в Пуэрто-Рико и на Кубе. Наконец, в 1512 году Фердинанд сделал королевский жест – подписал Бургосский конкордат, в котором огласил способ, с помощью которого он предлагал осуществлять свои новые широкие привилегии. В этом подробном и чрезвычайно важном договоре, почти каждый параграф которого приравнивается к какому-либо pragmatica (монарший указ) по тому или иному аспекту церковного управления, единственным самым важным пунктом было передаривание десятины. Обе стороны всегда понимали, что десятина, которую королевская власть имела право собирать, будет потрачена на содействие работе церкви. Договор конкретизировал это понимание. Корона уполномочила на неограниченный срок епископов в Индиях осуществлять сбор и распределение десятины со всей продукции, получаемой в Индиях, за исключением драгоценных металлов, которые десятиной не облагались. Распределение следовало осуществлять согласно обычаю, принятому в провинции Севилья: столько-то епископам, столько-то кафедральным соборам, столько-то нижестоящему духовенству и так далее; одна девятая оставлялась для короны. Этим далекоидущим законодательным актом король обеспечил церковь в Индиях постоянным доходом, поддержал сбор этого дохода весом своей королевской власти и гарантировал, что деньги будут потрачены людьми, которых он назначил, и согласно правилам, которые он одобрил.