Так по-дружески установленный Patronato (патронат) передал испанской короне огромную, уникальную власть. За исключением маленького завоеванного испанцами эмирата Гранада, ничего подобного в Европе не существовало, пока в XVIII веке испанские короли не закрепили за собой такую же власть в остальной Испании. Ни Фердинанд, ни Юлий II, конечно, не понимали до конца значения уступки, сделанной со стороны папской власти. В 1508 году «Индии» все еще означали, в сущности, остров Эспаньолу. Однако по мере продвижения открытий, завоевания и роста поселений этот термин с широким значением подчинил королевской воле все духовенство огромной империи. Король был лицом, назначавшим на должности; его административные представители, вице-короли и губернаторы тоже действовали как вице-руководители, проводя в жизнь его волю в церковных делах. Центральная администрация Patronato была вверена комитету – сначала Совету Кастилии, а после 1524 года Совету по делам Индий. В общей структуре Совета Patronato имел свою собственную канцелярию, состоящую из отделов, секретариат и архив, но монарх часто лично вмешивался в его дела, осуществляя власть квазипонтифика даже в вопросах религии и духовной юрисдикции. Проповедникам мог быть сделан выговор за «неумеренность в деятельности», епископам мог быть отдан приказ простить чиновников, которых они отлучили от Церкви. В плане привилегированных полномочий Patronato тяготел к тому, чтобы стать более широким и распространенным в применении и истолковании. При назначении епископов, например, роль короны была ограничена их представлением, так как ни один светский правитель не мог облекать духовной властью. Но на практике епископов выпроваживали в их епархии в Америке неподготовленными и нерукоположенными, где они немедленно приступали к работе, уверенные в том, что необходимые документы автоматически последуют из Рима должным порядком. Первый епископ Мехико святой Хуан де Сумаррага, вытащенный против его желания безо всякого предупреждения из малоизвестного монастыря по личному распоряжению Карла V после случайной встречи, провел четыре тяжелых года в качестве нерукоположенного назначенного епископа; его рукоположение сначала было отложено из-за разграбления Рима в 1527 году, а затем из-за случайной церковной ошибки. Все это время он считал себя обязанным принимать решительные и неотложные меры по защите местного населения, включая отлучение от Церкви Нуньо де Гусмана и других высокопоставленных представителей королевского audiencia (суд). Его действия явно не были освящены традициями, но их поддержала корона, и они возымели действие. Сумаррага был преданным священником, невосприимчивым к мнению людей и угрозам быть снятым с должности; но он был готов подчиниться распоряжению короля как приказу Бога. Позднее, когда он оказался вовлеченным в судебную тяжбу с Васко де Кирогой, епископом Мичоакана, по поводу границ епархий и других церковных дел, он не колеблясь адресовал свою апелляцию в Мадрид, а не Рим, считая Совет по делам Индий высшим церковным судом. Даже когда была желательна апелляция к Риму – что было очень редко, – Patronato делал это весьма затруднительным. Более того, корона контролировала все поездки в Индии и обратно. Ни один священнослужитель не мог поехать туда без разрешения Совета по делам Индий. Никакие прямые контакты не были возможны между Римом и духовенством в Америке. Никакие документы невозможно было распространять в Индиях без королевского одобрения. Pase regio – королевское разрешение на присутствие какого-либо церковнослужителя или распространение какого-либо церковного документа в Индиях – было односторонним и решительным расширением использования placet (санкция монарха на публикацию или исполнение какого-либо церковного указа, дозволение) и exequatur (разрешение на исполнение иностранного судебного решения) европейскими правителями – использования, которое было разрешено дипломатической традицией, но которое само по себе не было нигде признано папской уступкой. Pase regio никогда не было официально включено в Patronato, и папская власть никогда не принимала королевский довод, что оно подразумевается в нем. Тем не менее обнародование папских булл и бреве в Индиях часто откладывалось, а иногда и совсем прекращалось, если казалось, что их содержание может посягнуть на власть короны. Среди людей, преданных церкви и гордых своей правоверной набожностью, какими были испанцы, это были большие полномочия; неудивительно, что Patronato был среди самых ревностно охраняемых привилегий короны. Также неудивительно, что испанские короли при поддержке гражданских законоведов стали постепенно незаметно забывать, что оно появилось благодаря папскому дару и теоретически могло быть отменено, и считали его прерогативой, неотъемлемой от их монаршей власти. Его отдельные нарушения или критические выступления в его адрес жестко наказывались. Единственной серьезной попытке римского папы ограничить его действие (это был папа Пий V в 1568 году) было оказано сильное и успешное сопротивление.