Воспользовавшись царившими въ столицѣ смутами и измѣной, послѣдовавшихъ по убійствѣ царя Бориса, поляки овладѣли Москвой и въ 1605 году самозванецъ, лже-Димитрій І-й, достигъ трона, несмотря на анаѳему, произнесенную противъ него, какъ еретика, продавшагося Папѣ. Свергнувъ непокорнаго Патріарха Іова, поляки поставили грека Игнатія, признавшаго Гришку. Польша торжествовала, достигнувъ неожиданно исполненія своего завѣтнаго желанія — завладѣть русскимъ Кремлемъ. Женившись на Маринѣ Мнишекъ и вѣнчанный на царство какъ истинный сынъ Ивана Грознаго, Отрепьевъ щедро надѣлилъ семью своей супруги и поляковъ, тѣсно окружившихъ его тронъ. Черезъ своихъ покровителей іезуитовъ, онъ увѣдомилъ Папу Павла Ѵ-го о своей твердой преданности Католичеству. Обрадованный Папа приказалъ своему нунцію поднести Димитрію императорскій титулъ, взамѣнъ обѣщанія добиться отъ своихъ подданныхъ уніи съ Ватиканомъ.
Скоро лже-Димитрій показался народу тѣмъ, кѣмъ онъ былъ на самомъ дѣлѣ. Онъ глумился надъ церковными обрядами, не крестился передъ иконами, не молился до ѣды и всячески унижалъ своихъ подданныхъ. Такъ же вели себя чванные поляки, погруженные въ пьянство и развратъ. Самозванецъ, выгнавъ изъ Арбатскихъ домовъ священниковъ, помѣстилъ въ нихъ своихъ польскихъ друзей. Въ маѣ 1606 года, наконецъ, вспыхнулъ народный бунтъ и лже-Димитрій былъ убитъ.
Смута все возрастала и на Русь напали шведы, тогда какъ повсюду разбойничали всякіе «воры». На мѣсто убитаго самозванца, появился, снова изъ Литвы, новый лже-Димитрій, поощряемый тѣми же католиками. Такъ какъ многіе вѣрили въ спасеніе перваго самозванца, лже-Димитрій ІІ-й, въ свою очередь, изъявилъ претензіи на царство. Онъ такъ же окружилъ себя поляками и литовцами, къ которымъ примкнули казаки, искавшіе поживы въ общей сумятицѣ. Такъ какъ для Ватикана главной цѣлью было добиться уніи, то Папа Павелъ Ѵ-й и король рѣшили сдѣлать ставку и на второго авантюриста, которому удалось достичь села Тушино, находящагося въ 10 верстахъ отъ Москвы, откуда и кличка его «Тушинскій воръ». По настоянію іезуитовъ, вдова лже-Димитрія І-го Марина, согласилась на бракъ съ воромъ и была съ нимъ обвѣнчана… Со своей стороны, король призналъ вора, котораго усиленно торопилъ добиться уніи съ Римомъ. Кромѣ того, онъ убѣждалъ его запретить въѣздъ въ Россію всѣмъ противникамъ уніи, особенно греческимъ монахамъ, всюду учредить уніатскія церкви и семинаріи Восточнаго обряда и т. д. Это показываетъ, что ожидало Русь въ случаѣ окончательной побѣды Польши…
Къ счастью, во время смуты, единственной реальной силой явилась Русская Церковь. Св. Патріархъ Гермогенъ (1606–1612) далъ всѣмъ примѣръ мужества и непреклонности: будучи окруженъ врагами въ Кремлѣ, на положеніи узника, онъ своими грамотами повсюду воодушевлялъ Русь на ратный подвигъ противъ еретиковъ и недруговъ. Также надо особо отмѣтить героизмъ монаховъ Троице-Сергіевой Лавры. Въ продолженіи 16 мѣсяцевъ, она выдержала жестокую осаду поляковъ и тушинцевъ (самъ «воръ» былъ убитъ въ 1610 году). Подъ защиту стѣнъ Лавры собрались толпы народа, спасаясь отъ насилій и грабежей. Братія и стрѣльцы творили чудеса, отбрасывая всѣ атаки и выдерживая обстрѣлъ артиллеріи и минные подкопы. По примѣру Патріарха монахи разсылали патріотическія грамоты, всячески содѣйствуя начавшемуся въ Нижнемъ Новгородѣ освободительному движенію, руководимому Мининымъ и Пожарскимъ. Выдержавъ тяжкую осаду, Лавра поспѣшила снарядить на свои средства ополченіе, не прекращая оказывать помощь населенію, всѣхъ призывая къ походу для освобожденія Москвы, гдѣ былъ замученъ поляками Св. Гермогенъ.
За зиму 1611–1612 гг., къ нижегородскому ополченію примкнули отряды изъ другихъ городовъ, отъ Казани до Коломны. Въ октябрѣ 1612 года столица была, наконецъ, очищена отъ поляковъ, а въ 1613 году Земскій соборъ земли русской избралъ на царство юнаго Михаила Ѳеодоровича Романова, чѣмъ и прекратилось Смутное время.
Такъ Ватиканъ и Польша потерпѣли новое пораженіе насильственной латинизаціи Русскаго государства.
Какъ было сказано, послѣ обманной Брестской уніи католики получили полную свободу къ насилію надъ православнымъ населеніемъ, подъ предлогомъ оффиціальнаго запрета королевской властью ихъ Церкви. Гоненія, покрываемыя закономъ, поощряемыя іезуитами, особенно ожесточились въ Виленской области. Народъ всячески противился произволу польскихъ чиновниковъ, съ помощью самоотверженныхъ православныхъ братствъ, а такъ же такихъ стойкихъ церковныхъ очаговъ, какъ Кіево-Печерская и Почаевская лавры. Послѣ русско-польской войны 1648–1651 гг., Россія получила обратно свои южныя области и Кіевъ, гдѣ сохранилась вѣра, несмотря на всѣ насилія и принужденія къ уніи. Кромѣ братствъ, печатавшихъ многочисленные труды въ защиту вѣры, большую поддержку гонимые получали отъ казаковъ Запорожья, вѣрныхъ Церкви, которыхъ польское правительство опасалось издавна и ничѣмъ не смогло усмирить.