Основную массу этих поселенцев составляли запорожские казаки, малороссийские селяне и православное духовенство, но встречались и представители малороссийской православной шляхты, которые основали города Олешню и Ахтырку. Массовый исход запорожских казаков на Слободскую Украину начался при Б.М.Хмельницком, которые основали города Краснокутск (1651), Острогожск (1652), Сумы (1652), Харьков (1653) и другие. А в период «Руины» хлынула очередная волна переселенцев на земли Слободской Украины, где они основали новые города Салтов (1659), Балаклею (1663), Волчанск (1674), Изюм (1681) и другие. Как и в соседней Малороссии, управление здесь строилось на принципах военно-полковой системы, основу которой составляли Острогожский, Сумской, Ахтырский, Харьковский и Изюмский полки, старшина которых подчинялись белгородскому воеводе, назначаемому из Москвы. Кстати, что любопытно, для управления землями Слободской Украины в 1668 году был также создан отдельный госорган, который просуществовал до 1700 года — Великороссийский приказ.
После подписания «Вечного мира» с Варшавой гетманом Левобережья продолжал оставаться верный союзник Москвы Иван Самойлович, который особо отличился в Русско-турецкая войне 1677–1681 годов. Но после неудачи Первого Крымского похода князя Василия Голицына его сделали «козлом отпущения», лишили гетманской булавы и сослали в Тобольск. В результате, новым гетманом Малороссии стал генеральный есаул Запорожского войска Иван Мазепа (1687–1708), который сумел втереться в доверие к всесильному фавориту царевны Софьи и заполучить заветную гетманскую булаву. Кстати, такими же льстивыми посулами он сумел завоевать и расположение Петра I, хотя ближайшее окружение царя, в частности А.Д.Меншиков, П.А.Толстой и Д.М.Голицын, опираясь на достоверную информацию генерального судьи Запорожского войска В.Л.Кочубея и полтавского полковника И.И.Искру, не раз доносили ему о тайных сношениях И.С.Мазепы со шведскими агентами.
В итоге, в разгар Северной войны в 1708 году гетман-иуда предал русского царя и переметнулся в лагерь Карла XII, вместе с котором участвовал в осаде Полтавы, а затем и в разгромной для них Полтавской битве. После этого по приказу Петра I в новой гетманской столице Глухове была срочно созвана Общевойсковая Рада, на которой был избран новый войсковой гетман — стародубский полковник Иван Скоропадский. Хотя, уже в январе 1710 года после учреждения Киевской губернии, Петр назначил в Киев первого генерал-губернатора князя Д.М.Голицын, а в новую гетманскую ставку в Глухов для присмотра за И.И.Скоропадским направил «государева министра», бывшего суздальского воеводу А.П.Измайлова. Но даже в этих условиях казацкая старшина, различные группировки которой возглавляли И.И.Скоропадский, генеральный хорунжий Д.В.Забела и черниговский полковник П.Л.Полуботок, продолжала враждовать между собой, и буквально завалила Москву, а затем Петербург доносами и кляузами друг на друга. Кроме того, И.И.Скоропадский постоянно бомбил царя разного рода челобитными «об утверждении прав, вольностей и порядков, доселе бывших в малороссийском войске».
Русско-польская война 1654–1667 гг.
В конце концов, Петру I все это надоело и после приезда И.И.Скоропадского в Москву, в 1722 году он отменил выборность запорожского гетмана, назначил первого «наказного» гетмана Павла Полуботка и учредил Малороссийскую Коллегию, которуювозглавил бригадир С.Л.Вельяминов. Эта Коллегия была подчинена Правительствующему Сенату, в составе которого была учреждена и «Контора для малороссийских дел». Этим же петровским указом запорожскому гетману и генеральной старшине было предписано «никоих указов и универсалов без подписи Коллегии полковникам не посылать и бесправия не учинять…, дабы малороссийский народ ни от кого как неправедными судами, так и от старшины налогами утесняем не был». Правда, при Петре II, в мае 1727 года, Малороссийская коллегия была упразднена и восстановлена выборность гетмана, на которую был избран миргородский полковник Даниил Апостол (1727–1734). Но после его смерти, при Анне Иоанновне Кабинет Министров принял решение: «гетману дальнейшем быть не мыслится, а быть Правлению в шести персонам».