Позднее, между Варшавой и Вильно, то есть новым польским королем Владиславом (Ягайло) II (1386–1434) и великим литовским князем Витовтом (1392–1430) будут подписаны династические Кревская (1386) и Городельская (1413) унии, в результате чего началось ползучее, растянувшееся на целые десятилетия, ополячивание и окатоличивание русских земель, входивших в состав этих государств, «якоже в Коруне Польской». Позднее были заключены и другие династические унии, пока в разгар Ливонской войны польский король Сигизмунд II (1548–1572) не инициировал подписание новой унии о государственном объединении двух государств. В мае 1569 года оба сейма приняли Люблинскую унию о создании нового государства под названием Речь Посполитая («Общее дело»), а король Сигизмунд II издал универсал о присоединении к Польскому королевству Полесья, Волыни, Подолии и Киева. В результате, в составе Литвы остались только собственного литовские и часть западнорусских земель, в частности Брест и Пинск, а большая часть русских земель вошли в состав этнической Польши, на которых были созданы шесть воеводств: Подольское (Каменец-Подольский), Бельское (Белз), Русское (Львов), Волынское (Луцк), Брацлавское (Брацлав) и Киевское (Киев). Хотя уния и декларировала официальное равенство Польши и Литвы, практически сразу соотношение польских и литовских представителей в объединенных Сейме и Сенате установилось в пользу этнических поляков и католического духовенства. Результатом этого «равенства» стала полная дискриминация литовской и русской аристократии, шляхты и православного духовенства, поскольку в Сейме заседало 114 польских и только 48 литовских депутатов, а в Сенате против 113 поляков было лишь 27 литовцев. Одновременно в русских землях, вошедших в состав Польши, стала агрессивно продвигаться идея заключения унии между католической и православными церквами, идеологию которой обосновал иезуит Петр Скарга в своем трактате «О единстве Церкви Божией под единым пастырем» (1577). В итоге, из-за прямого предательства части высшего епископата Киевской митрополии во главе Михаилом Рогозой в декабре 1595 года римский папа Климент VIII подписал «Акт подчинения Киевской митрополии Римскому престолу», а в октябре 1596 года был созван II Брестский Собор, положивший начало созданию на территории Галиции и Волыни Униатской церкви.
Тем временем ситуация в русских воеводствах Польши стала резко обостряться, поскольку польская и местная католическая шляхта и магнаты стали подвергать тяжелейшему социальному, национальному и религиозному гнету местное русское население, где особую прослойку составляли казаки. Они делились на городовых или полковых и низовских или запорожских. Первые жили оседло в среднем течении Днепра и официально входили в число «реестровых» казаков, которые находились на службе у польской короны. Вторые — на островах за днепровскими порогами на территории Запорожской Сечи, которая возникла на границах с Крымским ханством еще середине XYI в. Формально запорожские казаки также считались подвластными польской короне, хотя фактически были независимы от Варшавы и все вопросы, в том числе решения об организации военных походов и разбойных набегов на сопредельные государства, решались на Общевойсковой Раде.
Переяславская Рада, 1654 год