По завещанию Б.М.Хмельницкого гетманскую булаву передали его сыну Юрию, но ввиду его малолетства, казацкая старшина, созвав в Чигирине новую Общевойсковую Раду, вручила гетманские полномочия генеральному писарю Запорожского войска Ивану Выговскому, который вскоре изменил Москве и в июне 1658 года подписал с Варшавой Гадячский мирный договор. По этому договору Гетманщина под названием «Великое княжество Русское» входила в состав Речи Посполитой как равноправная часть этого государства, наделенная внутренней автономией. При этом всей польской шляхте и церкви возвращалось все имущество и прежние земли. Первоначально статьи этого договора, были восторженно встречены «украинской» старшиной. Однако при их утверждении в Польском Сейме, многие из этих статей были отклонены польскими магнатами и шляхтой, и Гадячский договор был ратифицирован в сильно урезанном виде. Тем не менее, И.Е.Выговский, возложив на себя титул «Великого гетмана княжества Русского», переметнулся на сторону поляков и совместно с ними начал активные боевые действия против России. Однако против него вскоре выступила не только Левобережная, но и Правобережная Малороссия. В результате И.Е.Выговский бежал в Варшаву, а новым гетманом Запорожского войска стал Ю.Б.Хмельницкий — абсолютно ничтожная личность, страдавшая хроническими запоями.
В современной историографии события на «Польской Украине», которые развернулись после смерти Б.М.Хмельницкого и продолжались ровно тридцать лет (1657–1687) традиционно именуют очень емким и предельно точным термином «Руины», то есть Гражданской войной. Активное участие в этой войне, которая носила абсолютно беспринципный характер борьбы за власть, приняли участие разные старшинские группировки запорожского казачества и малороссийской шляхты, которые возглавляли то гетман И.Е.Выговский (1657–1658), то гетман И.Ф.Беспалый (1658–1659), то гетман Ю.Б.Хмельницкий (1660–1663), которые в нарушение всех соглашений с Москвой стали как политические проститутки метаться между Варшавой и Стамбулом, заключая с ними различные военные и политические союзы. В этой ситуации в 1662 году в Москве был создан Малороссийский приказ, который возглавил боярин П.М.Салтыков, поскольку внутренняя ситуация в «Польской Украине», де-факто вышла из-под контроля гетманской старшины. Уже к концу 1663 года Малороссия разделилась на две части: гетманом Правобережной (Польской) Малороссии стал переяславский полковник Павел Тетеря (1663–1665), которого сменил генеральный есаул Пётр Дорошенко (1663–1676), а гетманом Левобережной Малороссии был избран кошевой атаман Иван Брюхавецкий (1663–1668), которого затем сменил черниговский полковник Демьян Многогрешный (1668–1672). Надо сказать, что подобная «политическая проституция» была всегда характерна для всей казацкой старшины, которая постоянно металась в поисках более выгодных союзников, партнеров и спонсоров. И эта отличительная черта почти всей «украинской» политической элиты станет ее родовым проклятьем на все времена, а предательство будет возведено в ранг высшего достоинства чуть ли не каждого «украинского» политика.
Андрусовское перемирие де-факто закрепило за Российским государством всю территорию Левобережной Малороссии («Гетманщины»), занимавшую территорию современных Черниговской и Полтавской областей, а также значительную часть Киевской и Черкасской областей и незначительную часть Сумской области. На востоке она граничила со Слободской Украиной, а на юге — с землями Запорожской Сечи. В административном отношении эта территория, где сохранилась прежняя военно-полковая система управления, делилась на Черниговский, Полтавский, Переяславский, Миргородский и Прилуцкий полки, которые подчинялись малороссийскому гетману.
До сих пор существует расхожее представление, что вместе с Малороссией в состав России вошла и Слободская Украина, которая почти совпадала с границами современных Харьковской, Сумской, Луганской, а также частью Полтавской и Донецкой областей. Однако это не так, поскольку эти земли еще с начала XYI века принадлежали Московскому царству, где со времен Ивана Грозного началось создание Большой засечной черты, предназначенной для защиты рубежей Русского государства от постоянных набегов крымских и ногайских татар. Затем с конца XYI века правительство Бориса Годунова приступило к строительству Белгородской засечной черты, куда хлынул новый поток как русских поселенцев, основавших Белгород, Чугуев, Царёв-Борисов, Русские Лозовую и Тишки, так и малороссийских поселенцев из Русского, Киевского и Брацлавского воеводств.