Между тем, весной 1941 г. всем стала очевидна неготовность Италии к большой войне, в которую эта страна ввязалась из-за амбиций «дуче». Оборона греков в горах продолжала крепнуть, а итальянская промышленность с трудом восполняла потери в авиатехнике. Судить об этом можно хотя бы на основании того факта, что процесс перевооружения 35-й авиабригады продолжался, и конца ему было не видно. По состоянию на 5 апреля 1941 г., т. е. накануне германского вторжения в Грецию и Югославию но плану операции «Марита», в 86-й группе продолжали числиться 12 CANT Z.506B, поскольку выпуск бомбардировщиков CANT Z.1007bis крайне медленно набирал обороты. В то же время вмешательство в греко-итальянский вооружённый конфликт Германии со своими Люфтваффе, имевшими достаточное количество более совершенных разведывательных самолётов с превосходно подготовленными экипажами, почти автоматически сняло с пилотов «506-х» задачи по ведению разведки. Теперь они вылетали только дл
Начавшееся 6 апреля 1941 г. германское вторжение в Югославию и Грецию было немедленно поддержано итальянцами. В числе прочих сил, занятых в этом предприятии, были 12 «506-х», базировавшихся в Албании, и ещё несколько из состава 4-го воздушного района юго-востока Италии, а также бывшие гражданские машины компании «Ала Литториа». Кроме того, «Канты» принимали участие в захвате Ионических островов и в других операциях в Греции, наносили бомбовые удары по целям на прите, Кипре, а по ночам — даже в устье Нила.
С июля 1941 г. все эскадрильи, имевшие на вооружении CANT Z.506B, были окончательно переквалифицированы в разведывательные и поступили в подчинение авиационной службы итальянского Королевского Флота (Aviazione per la Regia Marina), продолжив разведывательную работу в интересах флота, которую они и так уже давно выполняли, ещё числясь бомбардировщиками. Кроме того, часть самолётов этого типа продолжала использоваться в качестве скоростных транспортных. Так, например, в числе прочих самолётов, поддерживающих наступление Роммеля к Эль Аламейну в конце мая 1942 г., были пять самолётов CANT Z.506B, а их предшественников «501-х» — 17.
В операциях в Греции значительная часть вылетов пришлась на транспортировку раненых и доставку предметов снабжения, что явилось дополнительной причиной к появлению в середине 1941 г. следующего варианта самолёта — специализированного спасательно-санитарного CANT Z.506S. Эта модификация представляла собой минимальную переделку поплавкового бомбардировщика-разведчика CANT Z.506B. С самолёта было снято всё вооружение, включая стрелковое, а в фюзеляже смонтировали четыре койки для раненых и место для фельдшера, оснастили входной люк новой лестницей, пригодной для принятия на борт раненых прямо с поверхности моря. Самолёты окрашивались целиком в белый цвет и несли на плоскостях и фюзеляже, помимо знаков национальной принадлежности, большие красные кресты. Помимо этого в поисково-спасательные были переделаны и большинство самолётов гражданских модификаций, получивших специальное спасательное и медицинское оборудование, а также характерные опознавательные знаки красного креста. Нужда в современных поисково-спасательных самолётах была настолько значительной, что в этот вариант переделали и часть оставшихся бомбардировщиков, причём на этих машинах иногда даже не снимали разоружённую верхнюю турель. Надо сказать, что это сыграло свою роль. Пилоты английских истребителей, видя перед собой самолёт с красными крестами, но оснащённый пулемётной турелью(!), отбросив всякие сомнения, шли в атаку и открывали огонь на поражение.