Зюганов срочно сделал заявление от имени президиума ЦК КПРФ. Он указал, что спринтерская скорость, с которой Ельцин выдвинул вторично Кириенко, доказывает, что он не собирается принимать во внимание результаты первого голосования и искать компромисса с Госдумой. Согласие в обществе, по Ельцину, это тогда, когда все согласны с ним, что бы ни пришло ему в голову. В отношении несогласных — шантаж, угрозы или подкуп.
Надежды думских коммунистов на то, что Конституционный Суд быстро рассмотрит их запрос о правомерности рассмотрения трижды одной и той же кандидатуры в парламенте, быстро улетучились. Председатель КС Марат Баглай не желал повторить печальный опыт Зорькина и вступать в конфликт с властями. Он заявил, что предварительное решение вопроса будет продолжаться до двух месяцев, затем судьи решат, принимать ли его к исполнению, а потому в случае положительного исхода дело встанет в общую очередь, будет рассмотрено в лучшем случае к зиме. Мнение парламентариев об особой важности запроса Баглай отверг, так как все дела важные и у него нет критериев для расстановки по ранжиру.
Вторая попытка проведения Кириенко 17 апреля также дала отрицательный результат — за Кириенко в ходе открытого голосования высказалось 115 депутатов.
Накануне решающего голосования состоялся телефонный разговор лидера парламентского большинства и Президента. Разговор был долгий и касался всех актуальных проблем — от Курил и до поведения Шахрая в Конституционном Суде. На просьбу Президента поддержать кандидатуру Кириенко Зюганов ответил — партия имеет принципиальную точку зрения на происходящее: продолжение курса приведет страну к окончательной катастрофе.
24 апреля 1998 г. состоялось третье голосование по вопросу о кандидатуре Кириенко. Зюганов выступил и напомнил, что Президент уже продавливал Хасбулатова. Продавливал Руцкого, трижды в Совете Федерации продавливал Илюшенко. Продавливая Кириенко, Президент рискует остаться один на один со всеми грандиозными проблемами, криминалом, олигархами, финансовым кризисом. Зюганов напомнил уроки истории, начиная с декабря 1916 г., когда царская Дума предлагала сформировать дееспособное правительство, а Николай II отказался, и это тогда закончилось революцией. Ведь можно извлечь уроки. Были уже октябрь 93-го, Чечня, воровская приватизация. Правительство и Чубайс с командой перечеркнули принятый бюджет. Оппозиция сняла вотум недоверия, но ни одно обещание, кроме «Парламентского часа», не выполнено. Всем ясно, что правительство Черномырдина не справляется, и можно было вместе с Думой сформировать работоспособное правительство, но опять все наизнанку. Сейчас надо рассмотреть десяток губернаторов и назначить нормального премьер-министра.
Вскоре состоялись голосования: два тайных и одно — открытое. В ходе тайного голосования большинство, включая часть голосов от оппозиции, поддержало Кириенко. По мнению ряда политологов, Зюганов при третьем голосовании был вынужден пойти на тайное голосование специально, с тем чтобы дать возможность части умеренных депутатов проголосовать за создание Правительства, что и произошло. Сам Зюганов отрицает такой замысел и говорит об отсутствии должной дисциплины во фракции, нестойкости отдельных депутатов-коммунистов.
Как оценить позицию Зюганова в этом парламентском кризисе? Во-первых, сам настаивал на голосовании фракции против кандидатуры и был готов к роспуску Думы.
Во-вторых, был вынужден учитывать определенный раскол в рядах фракции и опасения части ее членов, что нельзя оставлять Россию без полноценного правительства, а выборы преждевременны.
Оценки позиции Зюганова в обществе были противоречивы, причем как в левом, так и в правом лагере политических сил. Одни утверждали, что Зюганову удалось предстать конструктивной силой, укрепить политический авторитет, закрепить влияние на союзнические группировки, найти общий язык с НДР («Континент», «Московский Комсомолец», «Профиль», «Правда») и другие.
Другие настаивали, что противодействие коммунистов президентской власти носит теперь декларативный характер и единственная альтернатива связана с именами Лебедя и Бабурина («Независимая газета»), коммунисты стали орудием в руках финансового капитала. С этой целью владельцы телевидения пообещали лидеру КПРФ доступ к общенациональным ТВ-каналам. «Благодаря эфирному времени Зюганов оказывается заложником собственной демагогии и «бешеных» вроде прокурора Илюхина. Будь Зюганов хоть трижды Макиавелли и притом убежденным социал-предателем (и то и другое сомнительно), в тисках несвободы ему было бы крайне тяжко, если не вовсе невозможно эволюционировать к большей уверенности»