Данные о местоположении подводной лодки (широта и долгота), ее путевой скорости и истинном курсе поступали в приборы управления стрельбой от навигационной системы корабля. Специальная система контроля движения SAAVS вычисляла величины дрейфа и вертикального сноса, а также элементы бортовой и вертикальной качки.
Для контроля боеготовности баллистических ракет «Поларис А-2» на лодках кроме системы ПУРС Мк-80 установили цифровые автоматические контрольные устройства «Акре». Эти устройства осуществляли постоянный контроль за исправностью отдельных блоков ракеты с момента ее погрузки в стартовую шахту, периодический контроль всех систем запуска и управления полетом ракеты, полный контроль ракеты и отсчет времени в предстартовый период. Вычислительные устройства «Акре» работали по программе, вводившейся на перфоленте. Показания датчиков сравнивались с данными программы, и результаты отражались на световых табло и фиксировались на печатающих аппаратах. Устройства «Акре» соединялись с блоками ракет через центральный щит системы Мк-80, расположенный в помещении поста управления ракетной стрельбой. На щит выводились индикаторы контрольно-измерительных приборов, электронных вычислительных машин, аппаратура управления и т. п. Два оператора, обслуживавших щит, могли одновременно следить за состоянием всех элементов ПУРС и производить запуск баллистических ракет. Габариты щита системы Мк-80 относительно невелики: длина б м, высота 1,8 м. Щит сделан разборным (состоял из 12 блоков), что обеспечивало возможность погрузки его в лодку через входной люк.
Еще при эксплуатации стартовой системы на ПЛАРБ типа «Джордж Вашингтон» американцы столкнулись с рядом особенностей гидравлических демпферов. Угроза утечки жидкости через уплотнения гидравлических демпферов требовала непрерывного контроля. А так как расстояние между внутренним и наружным цилиндрами были относительно небольшие — всего несколько дюймов (1 дюйм равен 2,54 см), то доступ к гидравлическим демпферам для ремонта оказался затруднен.
Для подводных лодок типа «Этен Аллен» стартовая система была модернизирована. Новая модификация Mk-17 mod. 2 имела следующие отличия от Mk-17 mod. 1: гидравлические демпферы боковых перегрузок заменены пенопластовыми амортизаторами (гидравлические демпферы сохранились лишь в днищевой части шахты), сферический баллон для сжатого воздуха системы выбрасывания ракет заменен цилиндрическим, с меньшим весом по сравнению с прототипом, и вынесен за пределы шахты.
Поскольку новые амортизаторы из полиуретанового пенопласта, который поглощает ударные нагрузки так же эффективно, как и гидравлические демпферы, не имели движущихся частей, то уход за ними не вызывал никаких трудностей. Для изготовления амортизаторов применялись два вида пенопласта: непосредственно на внешней стенке пусковой трубы (внутреннего цилиндра) устанавливалась прослойка из твердого пенопласта, и уже к этой прослойке прилегали подушки из эластичного пенопласта, воспринимающие перегрузки. Твердый пенопласт отливался в формах, и после затвердевания обрабатывался и укреплялся на внешней стенке пусковой трубы с промежутками по высоте. Элементы амортизаторов из эластичного пенопласта выполнялись из больших кусков, обрабатывались до необходимой толщины на специальных горизонтальных приспособлениях и разрезались на полосы шириной около 15 см.
Собранные затем в группы по три элемента в каждой, эти подушки заключались в оболочку из тефлона и укреплялись между внешним стальным цилиндром ракетной шахты и слоем твердого пенопласта; такая конструкция обеспечивала пусковой трубе перемещение по вертикали и в боковом направлении.
Основным преимуществом новой системы амортизации явилось то, что сборка шахт и их испытание осуществлялись полностью на заводе-изготовителе фирмы «Вестингауз» и поставлялись они судостроительной верфи в виде готового блока. Фактически в этом случае к большим корабельным блокам применили агрегатный метод сборки, используемый в электронике. Весь блок стартовой установки строго проверялся на заводе-изготовителе и поставлялся на лодку в собранном виде. Это исключало необходимость повторной проверки на судостроительной верфи.
Замена сферического баллона цилиндрическим вызвана увеличением размеров БРПА «Поларис А-2». Цилиндрический баллон длиной 4,5 м, имеющий форму секции тора, был вынесен за пределы ракетной шахты и установлен рядом с ней, чтобы вписаться в габариты прочного корпуса ПЛАРБ. Эти резервуары были изготовлены фирмой «Кристайл Парк Воркс» (отделение фирмы «Ю.С. Стил»), Для наполнения резервуаров сжатым воздухом на каждой ПЛАРБ использовались три компрессора производительностью по 0,38 mVmhh.