Летом 1948 года прошли церковные торжества по случаю 500-летия автокефалии Русской православной церкви.
В Москве, на Конференции Православных поместных церквей, прошло соборное обсуждение проблем экуменизма – движения за объединение всех христианских Церквей. «Целеустремления экуменистического движения» признаны «не соответствующими идеалу христианства».
Сразу после войны власть разрешила открывать духовные школы. К 1953 году в стране уже действовало 20 тысяч православных церквей.
Но постепенно давление на Церковь стало вновь усиливалось. Так, Совет по делам Русской православной церкви вынудил Священный Синод принять решение о запрещении крестных ходов из села в село, духовных концертов в храмах во внебогослужебное время, поездок архиереев по епархиям в период сельскохозяйственных работ, служения молебнов на полях.
Новые нападки на Церковь начались с 1954 года. По указу руководителя Коммунистической партии Советского Союза и государства Н.С. Хрущёва вновь начали сносить храмы, закрывать приходы. Волна преследований остановилась после отстранения Хрущёва от власти в 1964 году.
Четверть века возглавлял Русскую православную церковь Алексий I (он скончался в 1970 году).
Итоги богословской и церковной деятельности подвёл поместный собор 1971 года. Собор ориентировал Церковь на активизацию деятельности по укреплению своего влияния на новые поколения верующих, расширению контактов с другими христианскими Церквями и объединениями. Собор избрал нового патриарха Пимена (в миру Сергей Михайлович Извеков). До избрания патриархом Пимен был митрополитом Крутицким и Коломенским.
Итоги тысячелетнего пути
Отношение к Русской православной церкви со стороны государства стало меняться с приходом к власти М.С. Горбачёва в 1985 году. Наглядным результатом этих изменений стало открытое празднование 1000-летия Крещения Руси в 1988 году.
В мае 1988 года состоялась встреча лидера КПСС и главы государства Горбачёва и патриарха Пимена. На этой встрече Горбачёв говорил о «неограниченном праве» верующих представлять свою веру с «достоинством» и заверил, что государство впредь в дела Церкви вмешиваться не будет.
В июне 1988 года столица СССР Москва стала местом встречи церковных руководителей со всего мира.
С 6 по 9 июня в Троице-Сергиевой лавре прошёл собор Русской православной церкви.
На день памяти мученика младенца Гавриила Белостокского 3 мая 1990 года в возрасте 80 лет Святейший Патриарх Московский и всея Руси Пимен (в миру Сергей Михайлович Извеков) скончался.
6 июня в Москве открылся поместный собор Русской православной церкви. 8 июня на поместном соборе Святейшим Патриархом Московским и всея Руси избран Алексий II (Алексей Михайлович Ридигер), митрополит Ленинградский и Новгородский.
В том же 1990 году, в сентябре, прошёл Архиерейский собор Русской православной церкви. Собор предоставил Украинской православной церкви независимость.
14 октября того же года впервые за 72 года состоялось торжественное богослужение, посвящённое празднику Покрова Пресвятой Богородицы, в храме Василия Блаженного в Москве.
В октябре того же 1990 года был принят новый закон о религии. Он расширил свободу действий Церкви и религиозных сообществ. Русской православной церкви стали возвращать церкви и монастыри. Она получила право открывать учебные центры и принимать участие в общественной жизни страны.
26 июля 1993 года Верховный Совет принял закон «О свободе вероисповеданий».