Пифагор и его последователи, по всей видимости, признавали магию во всех смыслах этого слова, и, хотя Платон с подозрением относился к магической практике, в последующие века маги, колдуны и чародеи быстро поставили его философию на службу своим целям. «Халдейский оракул» Юлиана Теургика (одно из основных магических сочинений начала нашей эры) насквозь пропитан идеями платонизма. Точно так же платонизм проникал и в различного рода мистические учения того времени. Он оказал глубокое влияние как на гностицизм, так и на герметизм, а отрывок из платоновского диалога «Республика», переведенный на коптский язык, одна из гностических сект даже причислила к своим священным книгам, найденным в Наг-Хаммади.
В начале III века н. э. платонизм вступил в новый период своего развития, и начало ему положил Плотин (примерно 205–270 гг. н. э.), которого еще иногда называют вторым основателем платонизма. В своих сочинениях (собранных после его смерти его учеником Порфирием Тирским) под названием «Эннеады» Плотин на основе учения Платона о мире бытия и мире становления разработал свою концепцию четырех миров. Согласно этой концепции царство становления поделено на хилический мир, или мир материи, и на физический мир, или мир обыденного сознания, тогда как царство бытия поделено на ноэтический мир, или мир эйдосов, и генадический мир, или мир высшего единства всего сущего. Современные ученые называют учение Плотина и его последователей неоплатонизмом, для которого характерен мистически-интуитивный подход к познанию мира. Во времена Плотина в римском мире набирало силу христианство, так что платонизм оказался одним из бастионов на пути нового вероучения. Ученик Плотина Порфирий написал даже трактат под названием «Против христиан», все копии которого были уничтожены после победы христианства в IV веке. Более широким размахом отличался проект Ямвлиха из Халкиды (умер в 330 г.), великого платоника IV века, стремившегося на основе платонизма объединить все языческие религии в борьбе против христианства. Прокл (412–485), последний из великих платоников-язычников Древнего мира, многое позаимствовал из идей Ямвлиха, разрабатывая собственную языческую теорию платонизма, в которой бы нашлось место для любого проявления языческой практики.
Ямвлих и Прокл, подобно большинству платоников последних двух веков Античности, были последователями нового, теургического, направления платонизма. Так называемые теургики объединяли изучение философии с магическими и религиозными ритуалами. Они учили, что подобно тому, как разумную сторону души следует просвещать посредством логики и философии, так и нерациональную сторону следует очищать и исцелять посредством ритуалов. Таких взглядов придерживались почти все основные защитники язычества в последние века Античности.
Интересно, что те же самые идеи, с помощью которых Ямвлих и Прокл пытались возродить и облагородить языческие ритуалы, некоторые христианские философы и теологи использовали для объяснения совсем других представлений о мире. Ориген (185–254), влиятельный христианский мыслитель III века, обучался в тех же платоновских школах Александрии, что и Плотин, и это был лишь один из ряда христианских платоников, оказавших большое влияние на развитие христианской теологии и философии.