Дрейк назвал эти острова Елизаветинскими, и их исследование дало важную космографическую и навигационную информацию. Многие картографы того времени считали, что существует огромная южная земля, Terra Australis, которая соединяется с Южной Америкой и простирается к нижней части земного шара. Пытаясь обнаружить эту землю, Дрейк проплыл на юг через созвездие островов, известное как Огненная Земля, и вышел в открытый океан, не обнаружив никаких признаков соединенного континента. Это позволило ему понять не только то, что Terra Australis, если она и существует, не связана с Южной Америкой, но и то, что можно обогнуть оконечность Южной Америки, а не проходить через сложный Магелланов пролив, и выйти в Тихий океан. Хотя этот маршрут был длиннее, чем путь через пролив, он мог стать желанной альтернативой, поскольку позволил бы английским кораблям избежать коварных условий Магелланова пролива и, что не менее важно, остаться вне пределов досягаемости Испании. Этот путь до сих пор известен как проход Дрейка.
Эта находка стала первым секретом Дрейка.
После того как Дрейк завершил разведку дальних границ Южной Америки, он намеревался вернуться в Англию, снова пройдя через Магелланов пролив, на этот раз с запада на восток. Но он столкнулся со свирепыми ветрами и решил направиться на север, вдоль западного побережья Южной Америки. По пути он грабил незащищенные колониальные порты Испании, жители которых были недоверчивы к тому, что английское судно достигло южной части Тихого океана.
У берегов Панамы Дрейк встретил испанское судно с сокровищами "Нуэстра Сеньора де ла Консепсьон", известное в народе как "Какафуэго", или "дерьмовый огонь". Почти наверняка оно направлялось из Перу в Панама-Сити, где должно было перегрузить свой груз серебра для транспортировки через перешеек в Номбре-де-Диос, чтобы его подобрала флотилия сокровищ. В порыве безудержного оппортунизма Дрейк захватил корабль и его сокровища, включая восемьдесят фунтов золота, двадцать шесть серебряных слитков и несколько сундуков серебряных реалов. Перегрузка клада с "Какафуэго" на "Золотой Гинд" заняла шесть дней.
Из-за своих грабежей - испанцы называли это пиратством и окрестили его El Draque, "дракон", - Дрейк решил, что испанцы скоро придут за ним. Поэтому он решил продолжить плавание на север, вдоль западного побережья Новой Испании (Мексики) и Северной Америки. Возможно, он надеялся найти устье Анианского пролива - северного канала, описанного сэром Хамфри Гилбертом в его "Рассуждениях" в 1576 году, который считался западным входом в Северо-Западный проход. Это обеспечило бы кратчайший путь домой в Англию, и именно это открытие надеялись сделать Кабот, Фробишер и Гилберт во время своих плаваний.
По пути на север Дрейк избегал испанских кораблей, но в конце концов столкнулся с другой бедой - непогодой. По свидетельствам современников, Дрейк и его команда столкнулись с "самыми мерзкими, густыми и зловонными туманами", а также с "порывами ветра" "такой силы и жестокости", что не могли бороться с ними. Экипаж "сильно страдал" от холода и жаловался на его "крайность". Чем дальше они плыли, тем холоднее становилось.
Как далеко на север забрался Дрейк, неизвестно. Возможно, он достиг сайта около 48 градусов северной широты, в районе современного Сиэтла. Во всяком случае, проведя в этом районе несколько недель, члены экипажа были "совершенно обескуражены" холодом, и Дрейк пришел к выводу, что "либо через эти северные берега вообще нет прохода (что наиболее вероятно), либо, если он и есть, он все же непроходим".
Флот Дрейка изменил направление. Следующие двенадцать дней они плыли на юг, пока не наткнулись на "удобную и подходящую гавань", расположенную примерно на 38 градусе северной широты, в районе современного Сан-Франциско. Здесь Дрейк и его команда пробыли пять недель. Во время стоянки они не раз сталкивались с местными индейцами - представителями прибрежной народности мивок, которые, похоже, считали англичан приезжими божествами. "Ничто не могло их переубедить, ни устранить то мнение, которое они сложили о нас, - что мы боги", - заметил Флетчер. Местный король дошел до того, что присягнул на верность Дрейку как послу Елизаветы - по крайней мере, именно так англичане истолковали эту церемонию. По-видимому, король предложил Дрейку предоставить "право и титул на всю землю" и даже "стать его подданным". Индейцы пели, водрузили на голову Дрейка корону и почтили его "именем Хиох".
У Дрейка не было опыта общения с такими людьми и в таких ситуациях. Он не хотел наносить обиды и отказываться от "чести и выгоды, которую это может принести нашей стране". Поэтому, во имя ее величества, Дрейк "взял в свои руки скипетр, корону и достоинство упомянутой страны" с пожеланием, чтобы "богатства и сокровища этой страны могли быть так удобно перевезены для обогащения" "королевства ее величества у себя дома".