Ферганский фронт, направляемый на борьбу с басмачеством, образовавшийся в феврале 1919 года, требовал от М.В. Фрунзе не только овладения Туркестаном, но и требовал разгром Семиреченского казачества. Обстановка в Семиречье была очень сложная. В марте 1918 года местное население этой богатой области отказалось признавать советскую власть. Затем туда ушла крупная войсковая группировка атамана Анненкова, отколовшегося от Колчака.
Еще весной 1919 года Михаил Фрунзе, бывший тогда командующим 4-й армией Восточного фронта, становится во главе Южной группой Восточного фронта в состав которой вошли 1-я, 4-я и 5-я армии и Туркестанская армия. Под его умелым командованием Южная группа в ходе последовательно проведенных наступательных операций разгромила противостоявшие ей войска адмирала А. Колчака. Теперь в августе 1919 года Михаила Фрунзе назначили командующим Туркестанским фронтом. Фрунзе подчинялись также все красные войска в отрезанном белогвардейцами Туркестане. Первоначально фронт провел Актюбинскую наступательную операцию по разгрому Южной армии белых под командованием генерала Белова. Затем удар был нанесен по белому уральскому казачеству. Местное население этой области отказалось признавать советскую власть, когда туда ушла крупная войсковая группировка атамана Анненкова, отколовшегося от Колчака. После освобождения Эмбинского нефтеносного района, штаб Фрунзе переехал из Самары в Ташкент.
В Закаспии войска Туркестанского фронта оказали военную помощь восставшим в Хивинском ханстве в их борьбе с Джунаид-ханом. Весной 1919 года была разгромлена Семиреченская армия атамана Анненкова. После этого Красная Армия, освободив Семиречье, вышла к китайской границе. Крупной операцией Туркестанского фронта стала Бухарская, проведенная в августе – сентябре 1920 года. Тогда советские войска при поддержке восставшего местного населения штурмом овладели столицей Бухарского эмирата городом Бухарой. 16-тысячная эмирская армия и 27-тысячное войско местных феодалов было разгромлено. Эмир бежал в Афганистан.
Одновременно советские туркестанские войска вели бои против басмачества, которые особо напряженными были в Ферганской долине, где действовали Мадамин-бек и Курширмат, «крестьянская армия» Монстрова. Будучи уроженцем Туркестана, Фрунзе отлично разбирался в мусульманском менталитете. Не ущемляя национального самолюбия, он ловко лавирует между амбициями азиатских курбаши и красных командиров. Фрунзе сумел сбить накал повстанческого движения. Командование Туркестанского фронта воздерживалось от излишней жестокости, стараясь убедить местное население, что политика властей направлена не против мусульман, а против бандитов.
Более подробно остановимся на операции по взятию Бухары, которая была начата в первых числах августа 1920 года. В распоряжении Фрунзе было 10 тысяч войск, 40 орудий, 230 пулеметов, 5 бронепоездов, 10 бронеавтомобилей и 11 самолетов. Армия эмира, напоминавшая неорганизованную толпу, насчитывала 27 тысяч человек, но у нее было всего 2 пулемета и несколько старых орудий. Вся большевистская Туркестанская армия была сконцентрирована уже 12 августа 1920 года на исходных позициях. Были созданы четыре группы войск – Чарджуйская, Каганская, Катта-Курганская и Самаркандская. Вся операция проходила строго по плану. 23 августа, как и условились, «большевики Бухары» подняли восстание и потребовали от эмира Алим-хана отречения от власти. Эмир отверг это требование и начал готовиться к войне. В связи с отказом эмира выполнить требование повстанцев руководство младобухарцев 29 августа обратилось к Фрунзе с просьбой оказать помощь в борьбе против эмира. Советское командование учло эту просьбу и в этот же день начало военные действия “бухарской операцией”.
Воскресным утром 29 августа Красная армия из Кагана, русского поселения близ Бухары, начала обстрел города, который был укреплен старинной глинобитной стеной высотой 5 метров с 11 воротами и 130 башнями. Снаряды красных не могли пробить стену. Первый день приступа не принес успеха большевикам, хотя на отдельных участках схватка доходила до рукопашной. Потери красных составили свыше 500 человек.
Через день М. Фрунзе осуществил массированную бомбардировку Бухары из всех орудий. Снарядов не жалели. Оставшийся в Ташкенте, Куйбышев занимался срочной переброской на фронт всего необходимого. Он выслал в Бухару курсантскую бригаду, дополнительные бронемашины. К вечеру красная артиллерия сделала пролом в стене, но ненадолго. Ночью бухарцы заделали его, но последовал новый штурм. Бронемашины оказались под самыми стенами города, неуязвимые для защитников. Под их прикрытием саперы взорвали стену. В пролом ворвался отряд особого назначения. К 6 часам при сильной артиллерийской поддержке были захвачены Мазар-Шарифские ворота. В 10 часов части Татарской бригады овладели Каршинскими воротами. Бой перекинулся на улицы. Город горел, жители разбегались. Остатки защитников укрылись во внутренней крепости – Арке.