Следующей по счету страной, получившей Ju 88 была Венгрия. Magyar Kiralyi Legero использовало Ju 88А-4 в дивизионе скоростных бомбардировщиков 102/2. Для обороны своей территории Венгрия также получила несколько истребителей Ju 88С-6. Таким образом, Венгрия стала единственной страной, которая получила Юнкерс в модификации истребителя. В марте 1943 года Финляндия получила 24 списанных самолета Ju 88А-4. После капитального ремонта они были направлены в PLeLv 44. Как и румынские машины, Юнкерсы, доставшиеся Финляндии были использованы против Германии во время так называемой лаппонской войны в конце 1944 – начале 1945 годов.
Французские ВВС, атаковавшие немецкие укрепления в Сен-Назере и Ла-Рошели, использовали Юнкерсы Ju 88А-4, построенные на заводе SNCASE в Тулузе. Всего заводы в Тулузе и Atelie Aeronautique de Boulogne поставили GB 1/31 22 самолета Ju 88A-4. Эти самолеты машины 18 боевых вылетов. Два французских Юнкерса были сбиты немецкой ПВО. После войны Юнкерсы направили в летную школу в Казо.
Первой частью, получившей разведчики Ju 88D была l.(F)/120, дислоцированная в Ставангере. Шесть машин Ju 88D-0 поступили летом 1940 года. К началу «Битвы за Англию» самолеты Ju 88D-2 уже были в большинстве частей дальней разведки: 1 .(F)/ 120. I.(F)/121, 3.(F)/122 – хотя в некоторых подразделениях продолжали использовать в качестве разведчиков обычные бомбардировщики. В 1941 году Ju 88D попали в разведывательные части, дислоцированные во Франции, на Сицилии и в Норвегии. 22 нюня 1941 года против Советского Союза немцы использовали несколько эскадрилий, оснащенных Ju 88D. В составе 5 Luftfliotte, действовавшею из Норвегии, Ju 88D имелись в l.(F)/120, в состав I Luftflotte входила 5.(F)/122, в состав 2 Luftflotte, действовавшего на центральном участке фронта, входила l.(F)/122. На Украине в составе 4- го Воздушного флота действовали 3.(F)/121. 4.(F)/121 и 4.(F)/122. Самолеты из 3.(F)/123. базировавшейся в Ланнионе в Бретани, совершали полеты над Атлантикой. Небольшое количество Ju 88D было у Венгрии и Румынии (2-й дивизион дальней разведки). В 1944 году самолеты Ju 88D стали заменять более совершенными Ju 88Т. которые развивали максимальную скорость до 660 км/ч. 2.(F)/AGr 11 и 3.(F)/AGr 33 использовали Ju 88Т до конца войны.
Самолеты Ju 88А состояли на вооружении Люфтваффе до капитуляции Германии. 4 марта 1945 года в операции «Gisela» (налет на города на востоке Англии) участвовали 142 самолета Ju 88 разных модификаций. В мае 1945 года в Исландии приземлился Ju 88A-I7 (1H+DF).
Первым получил самолеты Ju 88S I./KG 66, базировавшийся в 1944 году на аэродромах в Шартрезе и Мондидье. Юнкерсы участвовали в операции «Steinbock» (бомбардировки городов в восточной Англии). Ночью 24 августа 1944 года KG 30 во время налета на цели во Франции потеряла три Ju 88S-I (4D+FP.4D+DP.4D+MK). Самолеты Ju 88S-3 были в LG I. Ju 88S из II./KG 200 участвовали в ночных бомбардировках на Восточном фронте.