Налег был удачен – немцам удалось уничтожить на земле несколько «Спитфайров». 20 августа в 7:10 утра командир 302-го дивизиона RAF майор А.Дж. Сетчелл (Saychell) сбил один Юнкерс Ju 88А-1 (4D+IS) из 8./KG 30. Немецкий самолет рухнул у Натрингтона около Гулля. На следующий день Люфтваффе потеряло еще три Ju 88А – два из KG 54 и один из KG 30. 22 августа 1940 i-ода Ju 88А из KG 30 атаковали конвой «Тотгаз», шедший вдоль побережья Шотландии по направлению порта Уик. Истребители из 152-го дивизиона RAF сбили Юнкерс из 3.(F)/121, выполнявший разведывательный полет над Бристольским каналом. В сентябре-1940 года Ju 88А наносили удары по аэродромам и другим наземным целям, например оборонным заводам, разведывали и бомбили английские корабли и суда.
Особенно успешным оказался налет двух бомбардировщиков (вероятно из KG 51) на аэродром Бриз Нортон в графстве Оксфордшир, Самолеты сбросили две бомбы массой 250 кг и тридцать три бомбы массой 50 кг. Бомбы накрыли несколько ангаров, в которых стояли 46 учебных самолетов (Hawker «Hart», DeHavilland «Tiger Moth», Miles «Master» и Miles «Magiser»). Кроме того, было повреждено еще семь учебных самолетов и одиннадцать истребителей Hawker «Hurrikane» Mk. I, находившихся в ремонте.
Осенью и зимой 1940-1941 года Ju 88 участвовали в ночных налетах на города в южной и восточной части Англии. В ночь с 14 на 15 ноября немцы нанесли бомбовой удар по Ковентри.
В январе 1941 года Ju 88А находились на вооружении следующих частей Люфтваффе: 2-й воздушный флот (Luftflotte 2) – в KG 30 «Adler» было 90 самолетов из них 43 боеспособных, 3-й воздушный флот – в II./ KG и IIL/KG I «Hindenburg» было 55 самолетов из них 15 боеспособных, в KG 76 – 83 самолета Ju 88А (боеспособных только 6) и несколько более старых Dol7Z-2, в KG 77 было 87 самолетов (36 исправных), в KG 54 «Totenkopf» – 59 Юнкерсов Ju 88 (33 исправных), в LG 1 было 98 самолетов Ju 88А. В 806-й группе морской авиации (Kuestenfliegergruppe 806) было 12 Ju 88.