Особенно ему мешала постоянная нехватка продовольствия и фуража в армии. "Армия марширует на животе", * , конечно, но линия снабжения армии Северной Вирджинии была растянута, а Конфедерация была плохо организована для ее снабжения. В то время как армии Союза получали обильные припасы и могли строить огромные склады вблизи фронта, как тот, который Джексон только что уничтожил в Манассас-Джанкшен, армия Северной Вирджинии была вынуждена постоянно двигаться. Она жила за счет земли, потребляя продовольствие и фураж с ужасающей скоростью, и это делало трудным, почти невозможным для армии оставаться на месте долгое время или отступать по уже очищенной территории. Время и расстояние постоянно занимали мысли Ли, даже в момент победы, которая подтвердила его смелое решение оставить Ричмонд, перейти Раппаханнок и разделить свою армию перед лицом врага. В обозе Ли не было припасов; дороги перед ним становились "скверными и мокрыми", по выражению Лонгстрита, всегдашнего реалиста; армия была голодна, истощена и испытывала недостаток во всех видах боеприпасов. Несмотря на это, Ли был полон решимости еще раз попытаться отрезать основную часть армии Поупа, прежде чем она сможет достичь безопасного Вашингтона.
На рассвете 31 августа, надев "резиновый комбинезон и накинув на плечи резиновое пончо", Ли и Джексон поскакали на переправу через Булл-Ран, попав под обстрел вражеских пикетов с дальней стороны - доказательство того, что остатки федеральной армии все еще находятся в районе Центрвилла, за линиями, которые сами конфедераты вырыли годом ранее. Ли сразу же принял решение. Джексон, находясь дальше всех слева, должен был двинуться первым, переправиться через Булл-Ран у брода Садли-Спрингс, продвинуться на север широким фланговым движением справа от армии Поупа и попытаться отрезать ему путь к отступлению из Центрвилла - повторение стратегии Ли при Раппаханноке 25 августа. Лонгстрит должен был "оставаться на поле боя, ухаживая за ранеными и хороня мертвых, пока Джексон не начнет действовать", а затем последовать за Джексоном. Стюарту было приказано пересечь Булл-Ран с кавалерией и продвигаться к Окс-Хиллу и Фэрфакс-Корт-Хаусу, прикрывая войска Джексона и удерживая внимание Поупа - как раз тот вид яркой демонстрации, в котором Стюарт преуспел.
Приведя Джексона в движение, Ли ненадолго остановился у высокой железнодорожной насыпи, чтобы поговорить с генералом Лонгстритом, при этом поводья Тревеллера были свободно перекинуты через одну руку. На насыпь внезапно выскочил отряд федеральных пленных под вооруженной охраной, и Тревеллер в тревоге вскинул голову и "прыгнул назад", с силой бросив Ли на землю, вывихнув оба запястья и сломав небольшую кость в одной руке. Вызвали хирурга, и на обе руки Ли наложили повязки, лишив его возможности ездить верхом. В течение нескольких дней он был вынужден сопровождать свою армию в карете скорой помощи. Помимо сильной боли, несчастный случай стал "тяжелым испытанием для терпения генерала... поскольку неизбежно запряженное лошадьми колесное транспортное средство "не могло проехать во многие места, где лошадь могла бы его провезти".
Время и погода, а также его собственные ранения теперь работали против Ли. Лонгстрит последовал за Джексоном в 2 часа дня под "веселые" мелодии "Дикси", исполняемые армейским оркестром под проливным дождем. Войска шли, по словам Лонгстрита, "по одноколейной проселочной дороге, достаточно плохой на южной стороне реки, сильно изношенной... по зыбучим грунтам на северной стороне". Лонгстрит жаловался - с некоторой долей того, что звучит очень похоже на мелочность, - что если бы за Джексоном "следовал враг, чей марш он хотел сорвать, его орудийные повозки не смогли бы проделать более глубокий путь через грязь и зыбучие пески". Как ни тяжело было армии Лонгстрита пробираться по грязной дороге, уже протоптанной Джексоном, это также сделало бы продвижение скорой помощи Ли еще более медленным и неудобным, чем обычно. * Замкнутый в небольшом пространстве Ли не мог иметь четкого представления о происходящем.
Утром он получил от Поупа официальную просьбу о перемирии, чтобы забрать федеральных раненых с поля боя. Ответ Ли был взвешенным. Он разрешил федеральным санитарным машинам пересечь линию Конфедерации, но не согласился на перемирие. Как обычно, Ли был практичен и твердолоб. Он не хотел заваливать своих и без того перегруженных медиков несколькими тысячами федеральных раненых, а также не хотел, чтобы его тормозили формальным перемирием.