Он, правда, тактично написал Джексону, посоветовав, как поступить с А. П. Хиллом, но на самом деле это хороший пример его нежелания сталкивать лбами своих генералов. Он до сих пор не поспорил с Джексоном по поводу неоднократных неудач последнего во время Семидневной кампании и не приказал ему отбросить враждебность, которую тот мог испытывать к Хиллу. "А. П. Хилл - хороший офицер, - с надеждой писал Ли, как будто они никогда не встречались, - с ним можно советоваться, и, сообщая командирам своих дивизий о ваших передвижениях, вы избавитесь от многих проблем при согласовании деталей, так как они смогут действовать более разумно. Я хочу избавить вас от необходимости увеличивать численность вашего командования". Это был одновременно разумный совет и выдача желаемого за действительное. Джексон был гением, но угрюмым и непостоянным, и скрытность была частью его натуры. Он презирал "военные советы", ожидал, что его приказы будут выполняться мгновенно и без вопросов, и редко советовался с кем-либо, кроме самого Ли. "Ни один из командиров его дивизий не был проинформирован о его намерениях". жаловался позже генерал Уильям Б. Талиаферро, - "и их очень раздражало, когда им вслепую приказывали двигаться, не зная ни куда, ни с какой целью". Попытка Ли решить эту проблему была настолько вежливо сформулирована, что оказалась бесполезной, и не произвела никакого эффекта на Джексона, чьи подозрения в отношении А. П. Хилла оставались такими же сильными, как и прежде.
Как грандиозная стратегия Ли зависела от того, чтобы держать армии Союза разделенными, продвигаться между ними и атаковать ту, которая казалась слабее, так и его план в отношении Джексона зависел от способности последнего маневрировать и разгромить части армии Поупа до того, как Поуп сможет их сосредоточить. Военные историки критикуют Ли за то, что он не расширил свой штаб, не обеспечил достаточное количество современных карт и за многие другие недостатки армии Северной Вирджинии, но эти недостатки следует рассматривать в контексте его реалистичной оценки ситуации, в которой оказалась Конфедерация. Его главным врагом было время. Армии Союза могли быть усилены, увеличены и снабжены практически по желанию, но армии Конфедерации уже были напряжены до предела. Единственный способ для Ли победить - даже если "победа" будет означать лишь принуждение Севера сесть за стол переговоров - это наносить мощные удары снова и снова, пока его не одолела огромная численность. "Мы не можем позволить себе бездействовать", - писал он. Времени на совершенствование армии не было, даже если бы существовали ресурсы, с помощью которых можно было бы это сделать". С середины июля ему предстояло привести армию Северной Вирджинии в движение, чтобы провести вихревую череду крупных сражений одно за другим, практически не оставляя времени на отдых. Поскольку расстояния не были огромными - все сражения Ли проходили в относительно небольшом полукольце радиусом менее 100 миль, очерченном с северо-востока на юго-запад вокруг Вашингтона, большинство из них находились недалеко друг от друга, а некоторые сражались в одном и том же месте, - у Ли не было таких проблем с логистикой на больших расстояниях, с которыми пришлось столкнуться Наполеону (вспомните, например, Египетскую или Русскую кампании). Кроме того, большинство сражений Ли происходило в местах, где местное население полностью или частично симпатизировало Конфедерации (Геттисберг - заметное исключение); но если посмотреть на даты, то это все равно выдающееся достижение.
Проблему с картами вскоре поможет решить талантливый топограф Джексона Джедедиа Хотчкисс; более серьезную проблему поиска продовольствия и фуража можно было решить, заставляя армию двигаться, пока она не опустошила окружающую территорию, что отчасти объясняло набеги Ли на Мэриленд и Пенсильванию. Хотя Ли осуждал приказ "негодяя" Поупа о конфискации продовольствия и фуража у гражданского населения на территории Конфедерации и настаивал на том, чтобы его собственные квартирмейстеры платили за поставки, справедливости ради следует отметить, что они платили в долларах Конфедерации, которые падали в цене внутри Конфедерации и ничего не стоили за ее пределами.