Джонстон четко понимал ситуацию, хотя и не хотел делиться своими соображениями с президентом Дэвисом и Ли, и решил атаковать ту часть армии Макклеллана, которая находилась к северу от Чикахомини, прежде чем Макдауэлл успеет добраться туда из Фредериксбурга. Это были достаточно здравые рассуждения, но в самый последний момент вмешалась судьба в виде проливного дождя и известия о том, что Макдауэлл, встревоженный тем, что Джексон взял Винчестер, а Бэнкс полностью отступил, теперь марширует к Харперс-Ферри, а не к Ричмонду.
Ливень не только смыл работу инженеров Макклеллана, но и изолировал меньшую часть его армии слева от Ричмонда на участке, протянувшемся от реки на расстояние до шести миль от Ричмонда, в точке, доходящей до Фэйр-Оукс и Севен-Пайнс (последующее сражение известно как Фэйр-Оукс на Севере и как Севен-Пайнс на Юге). Как хороший боксер, Джонстон перешел с левого фланга на правый, изменив свои приготовления. Не сообщив о своих намерениях ни Ли, ни Дэвису, он атаковал левый фланг Макклеллана к югу от Чикахомини в полном составе с большей частью своей армии ранним днем 31 мая, на два дня позже, чем сообщил Ли. Грохот его пушек был отчетливо слышен в Ричмонде (и в палатке Макклеллана, расположенной в четырех милях от Нью-Бриджа, где он все еще был прикован к постели).
Теперь не было никаких сомнений в том, что Макклеллан получит поддержку Макдауэлла, хотя войска Макдауэлла находились менее чем в двадцати пяти милях от соединения с войсками Макклеллана, когда тот повернул назад, как показала смелая разведка кавалерийских разведчиков Дж. Джонстон получил возможность атаковать чуть больше трети армии Макклеллана всеми своими силами, благодаря терпеливой и осторожной поддержке Ли кампании Джексона в долине. Письмо Ли Джексону от 29 апреля принесло плоды именно так, как он и предполагал, хотя даже Ли, должно быть, затаил дыхание, когда Макдауэлл приблизился на расстояние двух-трех дней марша к стыку с Макклелланом. Узы доверия между Ли и Джексоном, созданные на расстоянии, должны были стать одним из самых важных оружий в арсенале Конфедерации. Если Ли был "Джовом" войны, то Стоунволл Джексон был его громоотводом. Для осуществления опасных планов Ли как раз такой лейтенант был незаменим".
30 мая, нетерпеливо ожидая, что его не допустят к предстоящему сражению, и все еще полагая, что атака произойдет к северу от Чикагомини, Ли отправил адъютанта на поиски Джонстона. Адъютант должен был сообщить ему, что Ли не может не участвовать в предстоящем сражении и будет рад командовать бригадой или даже полком, а также служить в любом качестве, независимо от своего ранга. Как обычно, Джонстон не обнаружил себя, и Ли, охваченный нетерпением, наконец поскакал в направлении Механиксвилла, где, как он все еще предполагал, произойдет атака Джонстона. Ничего не обнаружив, он поскакал обратно в Ричмонд, чтобы получить от Джонстона вежливое, но неинформативное сообщение о том, что он будет рад присутствию Ли на поле боя в любом качестве. Этой ночью дождь превратил дороги в грязь, Чикахомини затопила берега, но от Джонстона по-прежнему не было никаких известий.
31 мая Ли снова поскакал вперед в поисках Джонстона и наконец узнал, что тот сейчас находится на Девятимильной дороге, где-то возле Олд Таверн, к югу от Чикахомини. Это был первый признак того, что Джонстон решил атаковать левую часть линии Союза, а не правую. На перекрестке Девятимильной дороги и дороги, ведущей прямо к Нью-Бриджу, Ли увидел войска, выстроившиеся в боевую линию. Там, в скромном домике, где соединялись две дороги, он наконец нашел генерала Магрудера и самого генерала Джонстона, который, как ни странно, все еще не желал раскрывать свои планы. Вскоре после полудня Ли услышал пушечную и мушкетную стрельбу на юге. Войска, стоявшие перед домом, двинулись к нему, а генерал Джонстон вместе с Магрудером и их штабами последовал за ними. Генеральный почтмейстер Конфедерации Джон Х. Рейган - техасец, прискакавший из Ричмонда в качестве своеобразной группы поддержки Техасской бригады бригадного генерала Джона Белла Худа, - был там и "наблюдал продвижение" войск "на федеральные земляные укрепления, ощетинившиеся пушками". Он отметил, что они "шли в пасть смерти... со стойкостью регулярных войск".