Вопросом вопросов остается сегодня контроль захода в гавани судов, чтобы исключить проникновение кораблей, принадлежащих террористам. На это нацелен международный Кодекс безопасности портов и кораблей, принятый на Лондонской конференции Международной морской организации в декабре 2000 года. Он вводит меры превентивного характера и обязателен для всех судов, имеющих водоизмещение 500 тонн и больше – таких насчитывается более 55 тысяч, – и всех портов, которые обслуживают международные перевозки, их свыше 5500. Кодекс требует, чтобы каждый из таких кораблей нес строго фиксированный бортовой номер, позволяющий его мгновенно опознать и определить местонахождение. Экипаж должен быть подготовлен к отражению атак террористов, а само судно иметь систему оповещения береговых служб о нападении.
Не менее жесткие требования предъявляет Кодекс к портовым службам. Они должны быть готовы воспрепятствовать попытке проникновения в порт любого судна без соответствующих сертификатов и опознавательных систем. Кодекс безопасности вступил в силу с 1 июля 2004 года. Но большинство стран, подписавших Лондонскую конвенцию, не выполнили мероприятия, предусмотренные кодексом. Это произошло не из нежелания, а ввиду отсутствия средств, весьма немалых. В число таких стран входит большинство государств третьего мира. Сегодня и в дальнейшем их корабли не будут допускаться в порты стран, выполнивших его требования. Это нанесет колоссальный урон их экономике и заставит изыскивать лазейки, чтобы не подорвать окончательно свое судоходство. А кто может поручиться, что такого рода лазейки не найдет и штаб морских сил «Аль-Каиды»? Но, быть может, это им и не потребуется, поскольку корабли террористов имеют водоизмещение, не подпадающее под контроль кодекса.
Ежегодно с октября 2001 года проводятся масштабные кампании по контролю судов в наиболее опасных районах Индийского океана. Только за два года (2010-2012) было досмотрено 36000 судов, Результаты, однако, далеко не соответствовали затраченным усилиям: задержаны лишь 20 человек, подозреваемых в причастности к терроризму. Но не задержано ни одно судно из флотилии Бен Ладена.
Реализуется программа "Active Endeavour" (Активные усилия) – операции ВМС стран НАТО в Средиземном море, которые проводятся с целью предотвращения террористических акций и распространения оружия массового поражения или его компонентов, а также обеспечения безопасности судоходства. Эти операции были начаты в октябре 2001 года как одна из восьми операций НАТО в ответ на террористические атаки 11 сентября 2001 года, и проводятся в соответствии со ст. 5 Североатлантического договора о коллективной безопасности. Операции осуществляются двумя постоянными группами ВМС сил быстрого реагирования НАТО – Standing NRF Maritime Group 1 (SNMG1) and Standing NRF Maritime Group 2 (SNMG2). В состав SNMG1 обычно входят от 6 до 10 эсминцев или фрегатов и несколько вспомогательных судов Канады, Германии, Нидерландов, Великобритании и США. Время от времени к этой группе присоединяются корабли Бельгии, Дании, Норвегии, Польши, Португалии и Испании. В состав SNMG2 (4– 6 фрегатов или эсминцев и вспомогательные суда) на постоянной основе входят корабли Германии, Греции, Италии, Нидерландов, Испании, Турции, Великобритании и США. К этой группе на определенное время могут также присоединяться корабли других стран НАТО. Ротации кораблей в группах происходят каждые 6 месяцев. На данное время в рамках операции Active Endeavour проведен мониторинг около 100 тыс. судов, из которых около 100 были взяты на абордаж. Только до 2004 г. через Гибралтарский пролив было эскортировано около 500 судов.
В середине февраля 2006 г. заместитель госсекретаря США Курт Волкер заявил о желании распространить антитеррористические операции натовской программы "Active Endeavour" на Черное море. На это предложение охотно отозвалось большинство черноморских государств, включая Болгарию, Грузию, Румынию и Украину. Однако Турция и Россия решительно выступили против этой идеи. Общая позиция Москвы и Анкары заключается в том, что операции "BLACKSEAFOR" перекрывают объем задач, которые выполняет операция "Active Endeavour". Однако мотивы Москвы и Анкары кое-чем отличаются. Если Москве трудно смириться с тем, что Соединенные Штаты расширяют свою стратегическую роль в традиционно российской сфере влияния, то Турция желает сохранить статус-кво, установленный Конвенцией о режиме проливов Дарданеллы и Босфор (Монтре, 1936 г.), которая ограничила проход через проливы военных кораблей, одновременно усилив турецкий суверенитет над этими водными путями.