Двойное подчинение дорожно-строительных частей Главному управлению шоссейных дорог НКВД и Автодорожному управлению Красной Армии приводило к разобщенности их усилий. Решением ГКО силы и средства Гушосдора НКВД были переданы в состав дорожных войск Красной Армии, а их транспорт подчинен автомобильной службе. Полевые органы Гушосдора при фронтах и армиях были расформированы.
Возрастание числа автомобилей в войсках, а также размах проводимых операций все настоятельнее требовали дальнейшего улучшения дорожного обеспечения. Объем дорожных работ непрерывно увеличивался. В марте 1943 г. протяженность ВАД в полосах фронтов достигала 500–700 км.
В целях придания большей организованности в строительстве и восстановлении шоссейно-грунтовых дорог на театре военных действий постановлением ГКО от 9 июня 1943 г. № ГОКО — 3544с было создано Главное дорожное управление Красной Армии в составе Дорожно-строительного и Эксплуатационного управлений. В состав фронтов ввели дорожные управления, армий — дорожные отделы. В состав Главного дорожного управления были включены все военно-дорожные управления и отряды, а также Мостострой Гушосдора НКВД. Тем самым устранялась двойственность подчинения дорожных частей и восстановительных организаций. Это позволило создать стройную систему дорожного обеспечения в стратегическом и оперативном тылу Красной Армии. Уже в битве на Курской дуге это мероприятие позволило улучшить организацию дорожной службы.
Подтверждением тому служит сохранившееся в архивах донесение начальника отдела оперативного тыла Центрального фронта, где дается оценка автомобильных дорог в полосе 13-й армии. В частности отмечается, что все дороги спрофилированы, местами улучшены добавками шлака и гравия, мосты укреплены под нагрузку 60 т.
В составе Военно-воздушных сил были созданы специальные формирования для обеспечения войск всеми видами общевойскового довольствия и маневрирования запасами, имевшимися в батальонах аэродромного обслуживания и районах базирования, что позволило создать самостоятельную систему обеспечения личного состава ВВС, улучшить снабжение соединений, частей и подразделений продовольствием, вещевым и обозно-хозяйственным имуществом, квартирным довольствием.
Подверглись также реформированию силы и средства подачи материальных средств войскам морским, речным и воздушным транспортом. В действующую армию передавались морские и речные суда, а Главное управление Гражданского воздушного флота перешло в оперативное подчинение НКО.
В феврале 1943 г. на базе отдела материальных фондов НКО было сформировано управление материальных фондов. Таким образом, объединялись планирование и реализация материальных фондов, выделяемых СНК СССР, наркоматами и Промкооперацией на ремонт вооружения, боевой техники и имущества, а также на оборонительное и капитальное строительство.
В 1943 г. реорганизации коснулись финансовой и продовольственной служб. Так, финансовые органы соединений и частей действующей армии были подчинены заместителям командиров дивизий по тылу и помощникам командиров полков (отдельных батальонов, дивизионов) по снабжению (док. 15). Заместители командиров дивизий по тылу и помощники командиров частей по снабжению получили право распоряжаться всеми денежными средствами и право первой подписи на всех денежных документах. При этом на них возлагалась непосредственная ответственность за правильное расходование денежных средств в соответствии с действующими законоположениями.