Вмятины и разрывы, оставленные на корпусе "Хиппера" Тлоувормом", можно было ликвидировать только в доке, поэтому крейсеру следовало как можно скорее вернуться в Германию. Из-за недостатка топлива и неполадок в машинах его мог сопровождать только "Экольдт", однако когда оба корабля вышли 10 апреля из порта, продолжавшаяся плохая погода заставила эсминец вернуться обратно. "Хиппер" отправился в опасное путешествие один. Этот поход едва не стал для него последним. В ночь с 10 на 11 апреля курс германского крейсера практически пересекся с направлением движения флота метрополии, включавшего линкоры "Родней", "Вэлиент" и "Уорспайт", авианосец "Фьюриес", и тяжелые крейсера "Бервик", "Девоншир" и "Йорк". На счастье немцев, утром "Хиппер" оказался как бы "за спиной" у англичан, которые были полностью заняты подготовкой к воздушному удару по Тронхейму, не провели круговой воздушной разведки и не обнаружили находящийся всего в 30 милях крейсер. 12 апреля он благополучно соединился к югу от Эгерзунда с также отходящими домой после Норвежской операции "Шарнхорстом" и "Гнейзенау" и, удачно избежав авианалетов благодаря исключительно плохой видимости, прибыл вместе с ними в устье реки Яде вечером того же дня.
Ремонт нанесенных "Глоувормом" повреждений занял примерно три недели. Уже 8 мая крейсер прошел послеремонтные испытания и отправился в восточную Балтику, где и провел остаток месяца. 29 мая его отозвали обратно в Киль, где формировалось соединение, призванное облегчить тяжелое положение германских кораблей, "застрявших" в Норвегии и практически блокированных англичанами. Для этой операции, получившей название "Джуно", в Киле готовились старые знакомцы: "Гнейзенау", "Шарнхорст" и "Хиппер", эскорт которых обеспечивали эсминцы "Гальстер", "Лоди", "Штайнбринк" и "Шеманн". 4 июня соединение вышло в море, обошло минные заграждения и в полдень 5-го взяло курс на северо-запад, имея скорость 24 уз. 6 июня соединение встретило свой танкер "Дитмаршен" на широте Лофотенских островов. Отсутствие опыта в приеме топлива и плохая погода растянули процедуру заправки до самого вечера. Уже в сумерках командующий соединением адмирал Маршалл решил созвать военный совет. Командирам кораблей пришлось в бурном море садиться в шлюпки и отправляться на флагман, где адмирал собирался посвятить их в подробности намечавшейся атаки занятого англичанами Харстада. Однако уже в ходе совещания были получены несколько сообщений от подводных лодок, свидетельствующих о наличии в море трех британских боевых групп, причем все они шли на запад. Маршалл решил, что британцы эвакуируют свои силы, и удар его соединения может оказаться ударом в пустоту. Ночью он принял решение атаковать ближайший конвой и с рассветом растянул свои корабли в цепочку на расстоянии 90 каб. друг от друга. "Хипперу" опять повезло: уже в 6 часов он обнаружил торговое судно. В это время последовал приказ командования группы "Запад" отделить крейсер и эсминцы для атаки конвоя, тогда как линкорам было приказано все же атаковать Харстад. Пока передавались соответствующие сигналы, британское судно скрылось за струями ливня, и понадобилось некоторое время, чтобы вновь обнаружить его. Это оказался флотский танкер "Ойл Пайонир" (5700 т) в сопровождении 530-тонного траулера "Джунипер".
На долю "Хиппера" достался траулер. В 0700 орудия главного калибра крейсера были наведены на маленькое суденышко, не проявлявшее никакой реакции. Хейе пожалел дефицитные 203-мм снаряды и приказал открыть огонь из 105-мм зениток правого борта с дистанции не более 10 каб. Цель оказалась накрытой вторым залпом; на траулере возник пожар и он начал быстро крениться. Командир "Хиппера" приказал прекратить огонь, решив обследовать судно, но противник не проявлял никакого желания сдаться, и огонь был возобновлен. Долгой стрельбы не понадобилось: уже через минуту траулер опрокинулся и затонул. Всего в условиях плохой погоды крейсеру пришлось истратить для его потопления 97 105-мм снарядов. В это же время "Шарнхорст" поджег "Пайонир", окончательно потопленный торпедой с эсминца "Шеманн".