В конце кампании на Соломоновых островах на крейсерах «Сузуя» и «Кумано» появились радиолокаторы № 21. была усилена зенитная артиллерия кораблей. Существовали планы перестройки обоих крейсеров в корабли ПВО путем частичной или полной замены башен с 203-мм орудиями на башни с универсальными 127-мм пушками. Реализованы данные планы не были. Зато велась реконструкция находившегося на военно-морской верфи в Сасебо крейсера «Могами». Для усиления разведывательных возможностей флота было принято решение перестроить артиллерийский крейсер в носитель гидросамолетов-разведчиков по типу новейших кораблей «Тоне» и «Чикума». Две поврежденный кормовых башни главного калибра крейсера «Могами» были демонтированы. Взамен же смонтировали авиационную палубу с направляющими для четырех трехместных разведывательных гидросамолетов и трех двухместных гидропланов меньшего размера. Три носовых башни главного калибра остались на месте, из-за чего нарушился баланс масс в продольной плоскости корабля — крейсер теперь зарывался в воду носом. Перестроенный «Могами» повторно вошел в строй 30 апреля 1943 г. Крейсер придали 1-му флоту, а позже — 7-й дивизии 3-го флота. 19 июля 1943 г. при эскортировании конвоя с подкреплениями для защитников залива Вела, крейсер «Кумано» был атакован самолетов ТВМ-1, взлетевшим с Гуадалканала. Топмачтовым ударом американец уложил 900-кг бомбу прямо в крейсер. Взрыв бомбы вывел из строя машины корабля. Крейсер отбуксировали на Трук, а затем в Японию, где поставили в сухой док военно-морской базы Куре. Ремонт тяжелого крейсера продолжался до 31 октября 1943 г.
Находясь на якорной стоянке в Рабауле вместе с другими кораблями 7-й дивизии, «Могами» получил попадание бомбы, сброшенной с американского самолета. Бомба взорвалась на верхней палубе между башнями главного калибра № 1 и № 2. Повреждения оказались существенными. Крейсер «Могами» ушел в Куре под эскортом крейсера «Сузуя» в курс, где простоял на ремонте в сухом доке до 17 февраля 1944 г.
«Сузуя» и «Кумано» вернулись на Трук, откуда совершали походы с целью доставки людей и грузов на Эниветок, Кавиенг и Рой в течение нескольких месяцев. Из 7-й дивизии крейсеров был исключен «Могами», взамен в дивизию включили крейсера «Тоне» и «Чикума». Дивизия сама входила в состав 2-го флота и базировалась на Лингга Роад недалеко от Сингапура. Здесь на крейсерах опять усилили зенитное вооружение. доведя количество 25-мм автоматических пушек до 28. Крейсера 7-й дивизии и отремонтированный «Могами» приняли участие в сражении в Филиппинском море 19–20 июня. Тогда крейсера повреждений не получили, но после этого сражения, названного американцами «Великим избиением на Марианнах» резко было усилено зенитное вооружение кораблей: до 60 25-мм пушек на «Могами», 56 на «Кумано» и 50 на «Сузуя». На «Могами» теперь базировалось восемь новейших скоростных гидросамолетов Аичи Е16А.
После нескольких месяцев транспортных перевозок между Сингапуром и Филиппинами, крейсера 7-й дивизии и примкнувший к ним «Могами» начали подготовку к операции «Шо-И-Го», которая завершилась битвой в заливе Лейте. Тогда в состав 7-й дивизии 2-го флота входили крейсера «Сузуя», «Кумано», «Тоне» и «Чикума». Дивизия действовала в составе Центрального соединения адмирала Куриты. «Могами» же являлся частью сил контр-адмирала Нишимуры, помимо «Могами» Нишимура располагал старыми медлительными линкорами «Ямагшро» и «Фузо». четырьмя эсминцами. Согласно плану. Нишимуре предстояло атаковать через пролив Суригао с целью отвлечения внимания американцев и главной цели японского флота — уничтожения сил вторжения Объединенных Наций в заливе Лейте. В морс Сула «Могами» 24 октября 1944 г. был обстрелян неуправляемыми ракетами с истребителей F4F «Хеллкэт»; в результате обстрела на крейсере появились человеческие жертвы, а полетная палуба оказалась несильно разрушенной. На следующий день, 25 октября, соединение Нишимуры подверглось атаке торпедных катеров, которая была отбита артиллерийским огнем.