С точки зрения закона, к 1914 году подводная лодка, встретив торговое судно неприятеля, должна была всплыть и выслать досмотровую партию на его борт. Если установлено наличие запрещенного груза, судно считалось призом, требовалось вести его в свой порт или, при невозможности, уничтожить, обеспечив безопасность экипажа. Именно поэтому артиллерию на субмаринах за редким исключением не устанавливали примерно до 1912-1913 года. На русских лодках пушек не было.
Хотя в 1912 году подлодки принимали участие во флотских маневрах на Балтике и успешно атаковали дозор крейсеров, прорвав охранение из миноносцев, это не слишком изменило отношение командования к подводным силам. Такая точка зрения оказывала влияние на все подводное плавание. В 1914 году только 7 балтийских лодок выполнили 154 выхода в море и выполнили 179 торпедных выстрелов. Причем любопытно отметить, что у 3-х подлодок учебного отряда ("Стерлядь", "Пескарь", "Белуга") этот показатель составлял 129 и 131 соответственно, а у 4-х боевых лодок ("Минога", "Окунь", "Макрель", "Акула") – 25 и 48. Учебные лодки чаще выходили в море, но меньше стреляли торпедами (коэффициент торпеда / выход учебных лодок – 1,01, у боевых – 1,92). В 1914 году лодки участвовали в крупном флотском учении на Балтике. По итогам учения сделали вывод, что лодкам не придется действовать в отрыве от базы более 3 дней и в боевой обстановке погружаться глубже 15 метров и то на короткое время. Ночевки на грунте считались чем-то редкостным и чрезвычайным.
На вооружении русских подлодок находилась 450-мм торпеда образца 1907 года и её модернизированный вариант образца 1910 года. Особенностью вооружения русских подлодок было широкое применение торпедных аппаратов системы Джевецкого (они применялись и на флотах других стран, но ограниченно). В раме из двух балок на палубе размещалась торпеда и крепилась специальным стопором за хвостовое оперение. Балки могли поворачиваться на угол от 0 до 20 градусов по отношению к корпусу лодки. При подаче сжатого воздуха отходят балки и аппарат разворачивается на нужный угол, открывается курок запирающего клапана, и начинает работать машина торпеды. Затем отдается стопор, и торпеда идет самовыходом. Такая система имела очевидные плюсы – легкость, простота, отсутствие пузыря при выстреле, возможность стрелять веером. Это позволяло значительно усилить торпедное вооружение лодки. Однако оказалось, что укупорка торпеды не надежна, и она выходит из строя при нахождении на глубине более 20 метров. Торпеда сильно обмерзала и быстро ржавела, захлестываемая волнами при плавании в надводном положении. Пришлось срочно приспосабливать торпеду с надводных кораблей и только к 1916 году удалось создать надежный образец. Этот факт необходимо иметь в виду при анализе результативности наших подводников. В других флотах, в частности в английском, применялись бортовые аппараты. Но все они были только трубчатые. По мере развития противолодочных средств, а особенно появления глубинных бомб, такое размещение торпед на палубе стало просто опасным, и их стали демонтировать.
За время интенсивного учебного процесса с 1905 по 1914 годы произошел ряд аварий разной степени тяжести, но только однажды произошла катастрофа. Командир черноморского дивизиона капитан 2 ранга Н.М. Белкин в 1909 году приступил к обучению своих подчиненных атакам боевых кораблей в ночное время. Такого еще никто не пробовал в мире. 29 мая 1909 года комдив вышел в море на "Камбале" для атаки эскадры, возвращающейся после учений в Севастополь. Заняв позицию у Стрелецкой бухты, лодка стала ждать корабли, причем командир лейтенант Н.В. Аквилонов категорически возражал против атаки в подводном положении. После атаки броненосца "Пантелеймон" в позиционном положении лодка неожиданно повернула право на борт и оказалась на курсе броненосца "Ростислав". Отвернуть уже не успевали, и броненосец просто наехал на лодку, разрезал ее пополам и затолкал под воду. Спасся только один командир лодки. Позднее носовую часть "Камбалы" подняли, и рубка лодки служит памятником на братской могиле экипажа в Севастополе. Это единственный памятник подводникам Российского Императорского Флота.