Биолог-синтетик и теоретик сложности Стюарт Кауффман в своей книге Reinventing The Sacred исследует метафизическое значение эмерджентности. Кауффман отмечает, что в физике изначально нет ничего, что говорило бы о том, что она должна возникнуть и дать начало химии, точно так же, как в химии изначально нет ничего, что говорило бы о том, что она должна возникнуть и дать начало биологии. Ни будущее рождение химии и биологии не запрограммировано каким-то таинственным образом в Большом взрыве при зарождении Вселенной. Напротив, эмердженты имеют тенденцию возникать совершенно внезапно и независимо от всех ранее действовавших законов природы. Тем самым они добавляют Вселенной повышенную сложность, а не просто развивают нечто, заложенное в ней заранее, как трактуют функцию эмерджентности тоталистические детерминисты от Платона, Ньютона и Эйнштейна.
Кауффман утверждает, что очевидное присутствие эмерджентности означает, что к дарвиновскому естественному отбору должен быть добавлен принцип самоорганизации, чтобы науки могли объединиться и дать полное представление о различных природных процессах. Эмерджентность и ее самоорганизация просто добавляют в науку нечто фундаментальное, чего не хватает естественному отбору, а именно представление о том, как на самом деле возникает преадаптивный материал, который впоследствии становится основой истории успеха эволюционного процесса. Дело в том, что возникновение как таковое не является продуктом дарвиновского естественного отбора; скорее это нечто столь же удивительное, как внезапно возникшее и самоорганизующееся явление, спонтанно возникшее из дезорганизованного хаоса, которое впоследствии оказывается кусочком пазла, идеально подходящим к ситуации, когда обстоятельства в остальном дарвиновском процессе меняются.
Потенциальность возникновения основывается на одном простом принципе: сколько бы ни существовало в физике актуальностей, потенциальности, которые предшествуют этим актуальностям, всегда гораздо многочисленнее. Достаточно обратиться к генезису каждого человека, чтобы убедиться в этом: на каждого рождающегося индивида природа тратит миллионы и миллионы сперматозоидов, а также огромное количество яйцеклеток, которые так и остаются неиспользованными. И это мы говорим только о яйцеклетках и сперматозоидах, которые, несмотря ни на что, актуализируются именно как яйцеклетки и сперматозоиды - виртуальные яйцеклетки и сперматозоиды, в свою очередь, во много раз многочисленнее. Из этой бесконечной множественности эмердженты выделяются как великие победители, как возможности, которые сверхкреативная Вселенная рано или поздно все равно должна породить, и они впечатляют своей преадаптивной способностью к самоорганизации прочных и стабильных сложностей. Нет ничего странного в том, что на протяжении всей истории человечества люди позволяли себе увлекаться способностью природы генерировать эмерджентности.
С другой стороны, ошибочно представлять, что каким-то таинственным образом эти эмердженты являются данностями, что они следуют некоему металогическому закону природы - который в таком случае должен существовать еще до генезиса Вселенной, что, конечно, невозможно во внутренней самосозидающейся Вселенной без созидающего Бога, который одновременно является внешним и предшествующим. Вселенная не просто создала себя в прошлом, она создает себя постоянно. В этом Кауффман радикально расходится с редукционизмом, фундаментальной аксиомой науки со времен расцвета Ньютона. Согласно редукционизму, все можно вывести из иерархии вниз; как будто все, что возникает выше и позже, всегда полностью запрограммировано на одном из нижних уровней в предыдущий раз. Например, согласно редукционизму, биология - это всего лишь усовершенствованная форма химии, а химия - всего лишь усовершенствованная форма физики, и не более того.