Управление повседневными делами осуществляли пританы – 50 представителей от каждой филы в совете пятисот. Месяц в году они постоянно заседали в пританее – специальном здании, построенном для них, а потом передавали полномочия пританам – представителям другой филы.
Исполнительную власть в Афинах осуществляли выборные должностные лица (обычно для их обозначения используют латинское название – магистраты). Они избирались на год либо голосованием в народном собрании, либо посредством жеребьевки. Этот способ получил распространение на более поздних этапах развития демократии, поскольку отвечал представлению о том, что все граждане должны принимать участие в управлении государством. Жеребьевка, впрочем, не распространялась на самые ответственные должности, связанные с военным командованием или контролем за государственными финансами. Исполнение высших государственных должностей было почетной обязанностью: к этому стремились, невзирая на издержки, в том числе финансовые, потому что это было весьма престижно.
Между тем исполнение обязанностей в рамках государственных должностей было порой небезопасным занятием. После окончания срока полномочий магистрат должен был отчитаться, и, если его отчет не принимало народное собрание, он мог быть присужден к крупному денежному штрафу (Мильтиад, победитель персов при Марафоне, умер в тюрьме, куда его заточили на время, пока он не выплатит штраф).
Высшими магистратами в Афинах были стратеги (военачальники, генералы). Каждый год избиралась коллегия из десяти стратегов, по одному от каждой филы. Они возглавляли вооруженные силы полиса и имели наибольшее политическое влияние. Архонты, которые были высшими должностными лицами ранее, в архаический период, сохранились как магистратура, но политическое значение утратили. Еще с начала V в. до н. э. их стали выбирать по жребию, поэтому постепенно утратил свое значение (несмотря на временное усиление в эпоху Греко-персидских войн) совет ареопага, состоявший из бывших архонтов. Совет ареопага (или просто ареопаг) рассматривал только религиозные преступления.