И только 19 декабря 1918 года состоялось заседание бюро ЦК ВКП(б), на котором председательствовал В. И. Ленин, как глава СНК. На нем был заслушан вопрос об объединении деятельности ВЧК и Военного контроля. Бюро рекомендовало назначить заведующим Военным контролем М. С. Кедрова.
В ночь с 26 на 27 декабря 1918 года на заседании с участием Л. Д. Троцкого, И. И. Вацетиса, С. И. Аралова и Ф. В. Костяева — начальника Полевого штаба, было принято решение о назначении Кедрова начальником Особого отдела.
4 января 1919 года М. С. Кедров издал приказ № 1 по Особому отделу о немедленном слиянии на фронте и в округах органов Военного контроля и Чрезвычайных комиссий с новым названием — Особые отделы.
В инструкции Особого отдела ВЧК от 24 января 1919 года говорилось, что главные задачи для них сводятся к «обнаружению, обследованию и пресечению деятельности контрреволюционных и шпионских организаций» в РККА.
3 февраля 1919 года Ф. Э. Дзержинский рассмотрел разработанное М. И. Лацисом и М. С. Кедровым и утвержденное членами Президиума ВЧК «Положение об Особом отделе при ВЧК и его местных органах».
Для ликвидации параллелизма в работе в январе 1921 года на базе Особого, Секретного, Оперативного, Информационного и Иностранного отделов было создано Секретно-оперативное управление (СОУ) ВЧК. На него была возложена задача руководства по борьбе с политическим и военным шпионажем в масштабах всей страны. Во главе СОУ был поставлен В. Р. Менжинский.
Шло время, менялись вывески на фасаде органов госбезопасности СССР — ВЧК, ГПУ, ОГПУ, НКВД, но Особый отдел, как символ и название военной контрразведки, оставался неизменным. Отсюда емкое слово «особисты» обрело историческое звучание.
Большие организационно-штатные изменения в ВКР происходили в тридцатые годы. Так, в 1934–1938 гг. военная контрразведка, как Особый отдел — 5-й Отдел, входит в состав Главного управления государственной безопасности (ГУГБ) НКВД СССР.
23 мая 1936 года было объявлено Положение об Особых отделах ГУГБ НКВД СССР, согласно которому для сотрудников ОО корпусов, флотов, особых отделений дивизий, бригад, укрепрайонов, флотилий устанавливалась форма одежды и знаки различия военно-политического состава соответствующих родов войск согласно присвоенным им специальным званиям органов госбезопасности.
В марте 1938 года с упразднением ГУГБ на базе 5-го Отдела создается 2-е Управление (Особых отделов) НКВД СССР, а уже в марте 1938 года Особый отдел воссоздается, как 4-й Отдел ГУГБ, в подчинении которого находились Особые отделы (ОО) в РККА, РККФ и в войсках НКВД.
Данное положение оставалось до 1941 года, когда ВКР на короткое время перешла в ведение Наркомата обороны (НКО). На базе ОО ГУГБ НКВД было образовано 3-е Управление НКО. С мая 1941 года сотрудникам ОО стали присваивать звания политсостава РККА. Однако после возвращения ВКР с августа 1941 года в состав НКВД особистов вновь принялись переаттестовывать на спецзвания ГБ.
Директивой 3-го Управления НКО от 27 июня 1941 года о работе в военное время определялись следующие задачи:
1. Агентурно-оперативная работа:
— в частях Красной Армии,
— в тылах, обеспечивающих действующие на фронте части,
— среди гражданского окружения.
2. Борьба с дезертирством.
3. Работа на территории противника.
С учетом соблюдения режима секретности 13 июля 1941 года приказом НКО СССР и НКВМФ СССР было введено «Положение о военной цензуре воинской почтовой корреспонденции».
На укомплектование органов цензуры были направлены более 900 контролеров. В системе 3-х управлений НКО и НК ВМФ были образованы отделения военной цензуры.
17 июля 1941 года образуется Управление особых отделов НКВД СССР, просуществовавшее до 19 апреля 1943 года, когда было создано легендарное Главное управление контрразведки (ГУКР) «Смерш» с передачей его в ведение НКО СССР.
3 мая 1946 года ГУКР «Смерш» НКО СССР было снова реорганизовано в ОО МГБ.
С образованием в марте 1954 года Комитета государственной безопасности (КГБ) при СМ СССР военная контрразведка была переименована в 3-е Главное управление КГБ. Перед ВКР была поставлена задача проведения комплекса контрразведывательной работы в Советской армии и Военно-Морском Флоте.
Значительным событием в жизни КГБ, в т. ч. и военной контрразведки, явилось «Положение о Комитете государственной безопасности при Совете Министров СССР и его органах на местах». Положение действовало до 1991 года.
Потом были этапы становления ВКР на постсоветском пространстве, — в современной России — МБ, ФСБ РФ. В настоящее время центральным органом военной контрразведки является Департамент военной контрразведки.
Гражданская война и ВКР
Военные чекисты принимали активное участие в обезвреживании тайных врагов Советской власти с ориентацией на шпионскую и диверсионно-террористическую деятельность — Сиднея Рейли, Роберта Брюса Локкарта, Бориса Савинкова и др.
Такие операции, как «Синдикат» и «Трест», тоже не обходились без участия военных контрразведчиков.