Всем верующим рекомендовал прочесть работу Ивана Ивановича «Мысли о религии» Емельян Ярославский — еще одну содержательную книгу, созданную в те годы. (С 1922 года брошюра «Мысли о религии» выдержала шесть изданий.) «Мысли о религии», заметил Е. М. Ярославский, «проясняют сознание людей, разгоняют религиозный дурман, как разгоняют лучи солнца ночной мрак». Столь же высоко оценивала это атеистическое произведение советская массовая печать. Один рецензент в журнале «Книга и революция» отмечал, что «Мысли о религии» — «удивительно ясные и точные тезисы безбожия. Ни одного лишнего слова, мысль заострена, и закалена, и, кажется, способна прожечь мозг верующего. Это — не цветничок голых афоризмов и вялых сентенций, но геометрия Атеизма, сборник теорем, приноровленных к пониманию каждым грамотным человеком». А по словам старого большевика П. И. Флеровского, надо вручить книгу Ивана Ивановича «каждому агитатору, каждому рядовому коммунисту и широко распространить ее среди рабочих и крестьян».
Последней крупной в серии антирелигиозных книг Скворцова-Степанова можно назвать подготовленную в 1924 году работу «О вере в бога и вере в дьявола», в которой рассмотрена одна из самых черных и страшных страниц в истории христианской церкви — святая инквизиция и процессы против ведьм и колдунов.
Когда в один из майских дней 1924 года Ивана Ивановича попросила выступить комсомольская ячейка одной из фабрик Замоскворечья, он в самом начале вечера попросил сразу задавать ему вопросы по всем неясным проблемам атеизма и религии. Среди полученных в числе первых оказался вопрос о том, что такое инквизиция.
— Я сейчас закончил книгу именно на эту тему, — начал Скворцов-Степанов с явным удовольствием. — Поэтому сразу готов ответить. Христианская церковь, политическая наследница Древнего Рима, сосредоточила в застенках инквизиции все средства мучительства, до которых додумались эксплуататоры прежних веков, и бесконечно умножила эти средства своими собственными новыми изобретениями.
На многочисленных примерах Иван Иванович рассказал, как церковь расправлялась с оппозицией феодальному строю. «Святая» инквизиция пыталась кострами, на которых горели сотни тысяч невинных жертв, запугать миллионы эксплуатируемых, отбить у них охоту сопротивляться власти феодалов, и уничтожить все подлости средневековья. Только неописуемые пытки, подчеркивал он, заставили некоторых несчастных «сознаться» в отношениях с… дьяволом. А немало слабовольных людей невольно начинали верить в фантастические обвинения, исходившие от церковников.
— Такова мрачная действительность былой победы христианства над язычеством, — заключил в притихшем зале Скворцов-Степанов. — Для психиатра, для историка, вообще для науки между христианскими святыми и христианскими ведьмами нет никакой принципиальной разницы. Хочешь и признаешь святых — признавай и принимай ведьм. Смеешься над колдовскими воздействиями на дьявола — осмеивай и магические воздействия на бога. Отвергаешь существование дьявола — отвергай и существование бога.
Антирелигиозный вечер закончился поздно, но Иван Иванович не жалел о том, что некоторые срочные дела пришлось на это время отложить. Решил пройтись до дому с группой слушателей. Вопросы продолжали поступать и «на ходу». Понравилось одно выражение попутчика. Выходит, нет бога без дьявола и нет дьявола без бога?!
— Выходит, так, — ответил Скворцов-Степанов и, обняв за плечи юношу, добавил: — Нет веры без суеверий, и нет суеверий без веры. И здесь все это взаимосвязано.
— Над чем по атеизму вы еще работаете? — спросил тот же комсомолец.
— Начал работать в прошлом году над краткой историей Русской православной церкви, уже написал часть задуманного, дальше дело идет медленнее. Свои сомнения проверяю вот на таких вечерах-встречах, как только что закончившийся и немного продолжающийся, — засмеялся докладчик…
Скворцов-Степанов часто выступал с антирелигиозными докладами и лекциями в других городах и губерниях страны. Так, в январе 1919 года он выступал 18 раз, в феврале — 12 раз, а в марте — 22 раза. Он был одним из борцов за просвещение масс, принадлежал к славной когорте большевистских пропагандистов — представителей научного атеизма, в которую также входили Б. Д. Бонч-Бруевич, Е. М. Ярославский, А. В. Луначарский, П. А. Красиков и ряд других соратников В. И. Ленина. По мнению Емельяна Ярославского, трудно найти «еще одного такого же последовательного атеиста, безбожника-материалиста, каким был тов. И. И. Скворцов-Степанов». Это воинствующий атеист, «равного которому в нашем Союзе не было (не считая В. И. Ленина). Он умел подходить к самому темному человеку, разъясняя ему большую мысль… Он дал нам, безбожникам, образцы умелого пользования религиозными литературными произведениями, религиозными и народными сказаниями для антирелигиозной пропаганды». При этом, как заметил Н. П. Мещеряков, «антирелигиозная пропаганда никогда не снижалась до поверхностного балагурства, его брошюры были всегда построены на тщательном изучении истории и данных естественных наук».