Автор, классик по своему художественному мировоззрению, очень тактично решил архитектуру этой постройки. Он считал ее частью уже сложившегося ансамбля и, учитывая принцип симметрии, повторил южный фасад Димитриевского храма. Северный фасад Яковлевской церкви обработан таким же ионическим портиком большого ордера, в фронтоне которого вырезан тимпан, такими же малыми портиками у окон; храм увенчан таким же сферическим куполом на низком гладком барабане. Но он меньше по размеру, его не украшают скульптуры и барельефы, он скромнее и строже, как все постройки русской классики 1820 -1830-х годов.
Интерьер Яковлевской церкви расписан, видимо, сразу же после окончания ее строительства художником Тимофеем Медведевым родом из города Тейкова Ивановской области (в те времена вотчины Голицына). С его работами мы встретимся еще при знакомстве с Преображенским собором в Угличе.
Живопись выполнена клеевыми красками техникой гризайль в академической манере и мастерски сочетается с архитектурой. В центральной части церкви по традиции изображены четыре евангелиста, а на сводах — ангелы в медальонах. В эти композиции тактично введен цвет.
В классический ансамбль Димитриевского и Яковлевского храмов включена колокольня, поставленная на восток от них по оси, проходящей между этими сооружениями. Предполагают, что колокольня возведена между 1776 и 1786 годами, что вполне вероятно, так как древняя шатровая колокольня при церкви Зачатия была разобрана в 1786 году.
Колокольня трехъярусная. В нижнем ярусе расположены ворота с двухколонными портиками строгого тосканского ордера по сторонам. Во втором ярусе, обработанном пилястрами и с по-барочному срезанными углами, где поставлены колонны, сделаны открытые арки для звона. Мотив пилястр и арок повторяется и в третьем ярусе; здесь же расположены барочные люкарны для часов с боем. Завершена колокольня четырехгранным куполом с крестом на небольшом барабане. Колокольня построена из кирпича, а все детали: карнизы, цоколь, базы и капители колонн и пилястр выложены из белого тесаного камня. Несколько суховатая по исполнению, колокольня выполняет роль высотного сооружения ансамбля, столь любимого в русской архитектуре еще с глубокой древности.
В западной части монастыря расположены братские кельи и покои настоятеля. Выстроены они в разное время: в 1776–1786 годах — двухэтажные братские кельи в виде буквы „г“; в 1786–1795 годах — средний, примыкающий к ним, двухэтажный корпус с воротами в центре; и, наконец, последним был построен третий, примыкающий к среднему, двухэтажный корпус. Таким образом, получилась классическая планировка с курдонером.
Архитектура корпусов типична для жилых домов конца XVIII века; в рустованных пилястрах, плоских наличниках проявляются приемы классицизма, но все детали упрощены, чувствуется, что выполнены они с малой затратой средств и малоквалифицированными мастерами. На стиль жилых провинциальных домов конца XVIII века большое влияние оказал проект типового фасада, разработанного архитектором Бронниковым в Москве и разосланный по всем губерниям для использования.
Ансамбль Яковлевского монастыря в своей планировке и объемном решении ярко выражает стиль русского классицизма второй половины XVIII — начала XIX века. Монастырь красив и целостен с любых точек зрения, а особенно при подъезде к Ростову из Москвы, с озера и от кремля. Слияние архитектуры с природой, понимание зодчими задач архитектуры в данном ансамбле выражены с предельной покоряющей полнотой.
К территории Яковлевского монастыря примыкал Спасский монастырь, основанный во второй половине XIII века женой ростовского князя Василька, Марией. После гибели своего мужа она постриглась в монахини и была погребена здесь в 1271 году. Монастырь был упразднен по указу Екатерины II в 1764 году и приписан к Яковлевскому.
Первые каменные здания в этом монастыре были возведены в XVII веке, из которых сохранился лишь Спасский собор (другое название церковь Спаса на Песках, илл. 46). Датой его строительства на основании надписи, помещенной в храме, считается 1603 год. Однако, по-видимому, во второй половине века по какой-то причине храм был перестроен.
Стена южного фасада Спасского собора в двух первых ярусах расчленена лопатками на четыре части, причем эти членения по древней традиции не равны между собой; северный и западный фасады на такую же высоту застроены папертями-галереями; высота апсид также равна высоте двух ярусов. Стены собора над этими ярусами имеют уступ, что говорит о том, что в верхней своей части они тоньше. Невольно напрашивается гипотеза: не перестроен ли собор во второй половине XVII века с сохранением древних двух ярусов и апсид?
Фасады третьего яруса храма расчленены лопатками на три части, при этом членения зрительно равны между собой.