А у ЦРУ крепли подозрения насчет положения Попова. 18 сентября в мужском туалете ресторана Попову удалось передать агенту правдивое послание, написанное им без участия сотрудников КГБ. Оно было написано Поповым собственноручно, карандашом, на восьми клочках бумаги, туго свернутых в виде цилиндра размером с сигарету. Спрятаны они были в носовом платке, пришитом к карману брюк. Из текста послания, написанного, как подтвердил знакомый с ним много лет офицер ЦРУ, лично Поповым, казалось, что Попов составлял письмо в течение нескольких дней. Он сообщил о своем аресте в феврале и попытке преуменьшить значение своих связей с ЦРУ, «признавшись» в том, что стал «жертвой вашего давления[693]. Попов подтвердил подозрения ЦРУ в отношении того, что все встречи после февраля проходили под контролем КГБ. Ему обещали, что если он пойдет на сотрудничество, то они будут работать с ним как с агентом-двойником в Берлине. Хотя Попов и написал, что обращение с ним улучшилось после июльской встречи, полковник Звезденков, которого Попов назвал в качестве офицера, расследующего его дело, сказал, что еще рано говорить о посылке его в Берлин и продолжать разыгрывать там операцию как с агентом-двойником[694].
В своем тайном послании Попов высказал предположение, что КГБ готовит пропагандистский удар и объявит о его деле во время предстоявших переговоров Хрущева с президентом Эйзенхауэром. Он просил ЦРУ вступиться за него и особенно настаивал на неразглашении содержания его послания перед КГБ, поскольку КГБ хорошо осведомлен о делах в посольстве США. Попов понимал, что КГБ ему не доверяет. В части тайного послания, посвященного маршалу Жукову, Попов сообщил о том, что сразу после ареста его допрашивали два высокопоставленных офицера о речи Жукова, произнесенной в марте 1957 года в Германии в группе Советских войск. Одним из этих офицеров был генерал-майор Олег Михайлович Грибанов, начальник Второго Главного (контрразведывательного) управления КГБ.
Почему послание было таким важным, если ЦРУ уже заподозрило, что Попов работает под контролем КГБ? Помимо всего прочего, Попов совершил смелый акт верности своим обязательствам. Он не только подтвердил опасения ЦРУ, но и сообщил, что стало известно КГБ и что осталось неизвестным о его связях с ЦРУ. Не менее важно и то, что он написал о пропагандистской кампании. Но самое главное в его письме было то, что его допрашивали о Жукове. Получение на Западе речи Жукова возбудило подозрения КГБ в отношении причастности Попова к передаче информации. Но звезда Жукова уже закатывалась, и, возможно, допрос стал более активным благодаря уже знакомой связке кремлевских политиков и контрразведчиков КГБ.
14 октября 1959 года американский студент, завербованный Поповым с подачи БОБ, встретился со своим офицером ГРУ. Это была важная встреча. ЦРУ уже знало об аресте Попова, однако хотело как можно дольше сохранять студента в качестве двойного агента. Офицер БОБ объяснил ему положение, и студент сам должен был решить, идти ему на явку или нет. Он пошел, и встреча прошла без проблем. А потом КГБ довел игру до конца и 16 октября публично арестовал Попова и задержал офицера ЦРУ в автобусе 107. Предчувствия Попова оправдались. Начались аресты всех, вовлеченных в дело Попова. Так закончились для БОБ игры нелегалов.
Дело Попова слушалось на закрытых заседаниях Военной коллегии Верховного суда СССР 6—7 января 1960 года. Согласно отчету КГБ: «Принимая во внимание искреннее признание Поповым своей вины... [и] его желание полностью искупить вред, нанесенный его предательством, и спасти жизни доверившихся ему людей, КГБ вышел с ходатайством не применять к Попову смертную казнь». Тем не менее Попов был признан виновным и приговорен к смертной казни. Его расстреляли в июне 1960 года. Если учесть берлинский кризис в отношениях США и СССР в 1960 году, то рассчитывать на милосердие Москвы не приходилось. Решение, вероятно, было принято лично Хрущевым[695].