Тем не менее, несколько блестящих боевиков-продолжений данной серии, которые были сняты позже, показывают нам различные философские проблемы, такие, как проблема непостоянного пространства-времени или противоречия относительно понимания действительности, а также проблема свободы воли. Морфеус внезапно цитирует выбор Алисы, который она делает в глубокой кроличьей норе, в романе английского писателя Льюиса Кэрролла (L. Caroll) «Алиса в Стране чудес». Морфеус тоже предлагает Нео выбор из двух таблеток, красной и голубой. Если Нео выберет голубую таблетку, он и далее останется в иллюзорном мире, но, если он все же выберет красную таблетку, он сможет узнать, что из себя представляет реальный мир. Когда Андерсон выпивает красную таблетку, он обнаруживает не только то, что он живет в 2199 году, а не в 1999 году, как он думал ранее, но также и то, что в реальном мире он является лишь источником биоэнергии, пребывающим в иллюзорном мире, Матрице. Нео (так зовут Томаса Андерсона в «Матрице») сбит с толку тем фактом, насколько программа Матрицы является переплетением иллюзии и реальности.
Есть интересная реплика Морфеуса, где он говорит, что реальность необязательно должна быть связана с восприятием реальности или объективной реальностью как таковой.
То, что он чувствует в Матрице, отличается от реальных ощущений, и мир Нео до того момента, как его разбудили, замыкался только на том, что ему говорил его головной мозг. Матрица – это система, которая отбирает индивидуальные чувства и мысли, она представляет собой завесу, которая не позволяет людям видеть себя рабами. Морфеус говорит, что реальность представляет собой набор субъективных ощущений, что она – всего лишь электрический сигнал, который головной мозг обрабатывает и формирует таким образом некие представления. Парадокс в том, что сознание и границы познания не могут быть уменьшены только благодаря воздействию на головной мозг. Для Морфеуса мир за пределами Матрицы реален и правдив. Постепенно и Андерсон начинает понимать, что мир, в котором он жил, был ненастоящим, миром, которым управлял искусственный интеллект.
Реальный мир, который Морфеус показал Нео, похож на антиутопию («Вспомнить все» или серия фильмов «Терминатор»), изображенную в других научно-фантастических фильмах. Морфеус рассказывает Нео историю развития науки и техники после XX века. С изобретением искусственного интеллекта (artificial intelligence), имитировавшего человеческий интеллект, машины обрели собственное самосознание, и их отношения с людьми в формате хозяин-раб изменились, и машины восстали против своих создателей. Поскольку машины становятся субъектами истории, человечество сражается с ними и в битве за независимость. Оно заслоняет солнце вечными тучами, чтобы прекратить работу солнечных батарей, питавших машины энергией, но это не приносит того результата, на который люди рассчитывали. С тех пор по сюжету фильма война между человечеством и машинами не прекращается.
Процесс, с помощью которого Нео и Морфеус осознают несправедливость и стремятся к освобождению, кажется, демонстрирует процесс обретения свободы посредством рационального мышления, который Кант проанализировал в своей «Критике чистого разума». Кант считает, что причиной действия является природа или свобода. Природа – это другое название эмоционального мира, напоминающее действия, которые непосредственно стимулируют чувства или поведение животных. В это время связь между неким состоянием и следующим за ним состоянием действует как условие формирования причинности. С другой стороны, свобода берет свое начало не в природе, а в самой себе и представляет собой вечную чистоту идеи, независимую от мира опыта.
Поскольку свобода подразумевает наличие добровольного желания у стремящегося к свободе человека, то для освобождения непременно должно быть искреннее желание освободиться от принуждения и сковывающих пут. Практика свободы имеет свои особенности, то есть то, что должно произойти, а не то, что происходит. Поэтому, если отказаться от практической свободы, это также будет означать то, что нельзя будет наслаждаться свободой и в высоком смысле этого понятия. Попытка свободно вырваться за пределы опыта не является «физиологическим (естественным), но трансцендентальным (более высоким)»[335] стремлением. Стремление к освобождению Нео и Морфеуса можно понять не как физиологическую потребность, вызванную каким-либо внешним стимулом, а как потребность, продиктованную их рациональным мышлением.