1961.В мае-июне 24 лучших экипажа полка готовились к воздушному параду в День Воздушного Флота. Гвардейцам доверили продемонстрировать новый самолет перед всем миром. Сначала отрабатывали групповую слетанность пар и звеньев, одновременные взлеты парой и звеном, а также всей группой с интервалом 20 секунд между звеньями. А 29 мая вся группа из 25 самолетов перелетела в Мигалово, где началась отработка полетов строем всего парадного расчета. Точность выхода групп в в точку сбора составляла 5 секунд.
9 июля в 9.30 начался взлет участников парада и их сбор в полковую колонну на главную парадную петлю. 21 самолет Як-27Р 47 ОГРАП в четком монолитном строю, секунда в секунду прошли над Тушино на высоте 125 метров и скорости 850 км/ч. Для большего звукового эффекта экипажи открыли люки перспективных аэрофотоаппаратов.
К концу года 33 экипажа могли вести воздушную разведку днем, а 23 из них — и ночью в ПМУ.
1962.Но даже высокий уровень подготовки не гарантировал от случайностей. В июне во время ночных полетов, у самолета гв. ст. л-та Пеганова (штурман гв. ст. л-т Балденков) на пробеге убралось шасси. Летчик быстро выключил двигатели, обесточил самолет и вместе со штурманом покинул его, не доложив группе руководства. Садившийся следом Як-27Р гв. ст. л-та Воробьева увидел оставленный на ВПП самолет слишком поздно. Обе машины при столкновении были очень сильно повреждены (самолет Пеганова отправили как пособие в одно из технических училищ, а Як-27 Воробьева — на свалку), но никто не пострадал.
18 октября в полк прибыл новый командир, гв. п/п-к И. Гуржий — с этого момента он возглавлял полк 10 лет, дольше всех других командиров. Его вступление в должность пришлось на один из самых напряженных моментов в истории — во время Карибского кризиса полк был приведен в полную боевую готовность. Личный состав переведен на казарменное положение. Сменяя друг друга, одно звено разведчиков круглосуточно находилось в готовности № 1, и по одному звену в готовности № 2 и № 3. Так продолжалось до конца октября.
1963.Поскольку Як-27 не имел учебно-тренировочного варианта с двойным управлением, подготовка летчиков производилась на Як-25М. В конце февраля им на смену появились 3 новых учебно-боевых самолета Як-28У. По летным характеристикам и технике пилотирования новая спарка значительно отличалась от Як-27Р, и эта замена оказалась чрезвычайно необдуманной. Но из всего семейства Яков именно Як-28У служил в 47-м ОГРАП дольше всех — почти 20 лет.
Год оказался очень насыщенным в отношении учений, тревог и проверок. 23–24 мая 32 экипажа принимали участие в ЛТУ полка с ведением разведки РЯС на незнакомых полигонах ПрикВО и с посадкой на аэр. Коломыя 57-й ВА. 1–7 июля полк был проверен комиссией ГИМО. Наряду с хорошими и отличными оценками по всем видам боевой подготовки было отмечено нарушение приказа МО СССР «летать без аварий и катастроф» (столкновение самолетов на ВПП) и общую оценку снизили до удовлетворительной. 9-10 сентября в ходе ЛТУ полка с посадкой на аэр. Буялык (ОдВО), экипажи выполняли разведку на незнакомых полигонах этого округа: Тарутино, Киево-Александровский, мыс Свободный Порт, а также разведку ВМБ Одессы, Ильичевска, Николаева и др. 26 сентября, при отработке вывода полка из-под удара по тревоге, за 4 минуты 19 экипажей произвели старт парами из Шаталово и по трем разным маршрутам выполнили перелет на аэр. Тамбов с выполнением попутной разведки.
Осенью впервые проводились соревнования по воздушной разведке. Первое место в них занял экипаж командира 3-й АЭ гв. м-ра Коваленко и штурмана АЭ гв. м-ра Коннова.
1964. С 13 января полк переведен на новую организационно-штатную структуру: инженерно-авиационная служба ТЭЧ эскадрилий выведена из состава ИАС полка и включена непосредственно в боевые подразделения.
Летный состав продолжал осваивать Як-28У, а также отрабатывал полеты на боевых самолетах на предельномалых высотах (100–150 м).
3 июня в учениях с перебазированием на аэр. Буялык принимал участие 21 экипаж. Особое внимание уделялось ведению разведки на предельно-малых высотах и преодолению воздушных пространств, зараженных радиоактивными веществами с дезактивацией самолетов после посадки.
1965.В этом году полк готовился к боевым действиям: разведке, доразведке и определению координат подвижных малоразмерных объектов в оперативной и тактической глубине. Дополнительные трудности создавало преодоление сильной ПВО противника на предельно-малых высотах и больших скоростях с переменным профилем. Продолжались испытания лидерных самолетов, начатые в 1962 г.