Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции

Таблица 12-1

Некоторые из функций рибозимов, потенциально важные для биологической эволюции

[Реакция] / Свойства рибозима

[Синтез аминоацил-аденилатов] Низкоэффективное образование лейцил- и фенилаланил-аденилатов наблюдалось со 114-нуклеотидным рибозимом.

[Авто-аминоацилирование] Авто-аминоацилирование 43-нуклеотидного рибозима фенилаланином с Фен-АТФ в качестве субстрата. 77-нуклеотидная РНК катализирует ту же реакцию с более высокими избирательностью и скоростью авто-аминоацилирования, чем Фен-РСаза.

[3’-аминоацилирование РНК in-trans] Минимальный рибозим, способный к не избирательному аминоацилированию тРНК, состоит из 29 нуклеотидов. Был получен 45-нуклеотидный рибозим с широким спектром действия на разнообразные тРНК и аминокислоты. Сообщается также о высокоизбирательном и эффективном аминоацилировании более длинных рибозимов.

[Рибозимы-пептидилтрансферазы, отобранные in vitro] Отобрано несколько рибозимов, образующих дипептиды из аминокислоты, связанной эфирной связью с АМФ, или олигонуклеотида и свободной аминокислоты. Обнаружено структурное сходство между рибозимами пептид илтрансферазы и соответствующим участком 23S рРНК. Описано образование Фен-Фен-тРНК 29-нуклеотидным аминоацилирующим рибозимом.

[Рибосомная пептидилтрансфераза] В больших рибосомных субъединицах центр пептидилтрансферазы картируется в участке, содержащем только РНК, подводя к заключению о том, что реакция катализируется рибозимом; идентификация активных остатков, однако, пока не удается.

[РНК-лигаза] Многие рибозимы способны лигировать молекулы РНК, прикрепленные рядом к молекуле рибозима при помощи спаривания оснований.

[РНК-полимераза] Из числа РНК-лигируюших рибозимов были отобраны способные к удлинению предварительно отожженного праймера на 10–14 нуклеотидов.

Заимствовано с дополнениями из Wolf and Koonin, 2007.