19 ноября 1944 г. на рейд прибыли линкор "Харуна", тяжелые крейсера "Ашигара" и "Хагуро", легкий крейсер "Ойодо". Из Манилы прорвались 4 эсминца, на одном из них находился командующий 5-м флотом вице-адмирал К. Шима. Вскоре его флаг был поднят на крейсере "Асигара".
20-22 ноября флот совершил переход на якорную стоянку Линнга Роудз, в окрестностях Сингапура. Затем 12 декабря японское соединение: "Исе", "Хыога" "Асигара", "Ойодо" перебазировались в Камрань. Там они пополнили запас топлива, и ждали возможности атаковать вражеский конвой, идущий на Минданао. 14 декабря их обнаруживает на якорной стоянке подводные лодки "Бэшоу" (SS-241) и "Гуавина" (SS-362), но занять позицию для атаки им не удалось.
В этот же день адмирал Шима перенес флаг на "Хыогу". 17 декабря американская субмарина "Минго" (SS-261) обнаружила неприятельское соединение в бухте Камрань, но выйти в атаку не смогла. 18 декабря "Исе" и "Хыога" перебираются на якорную стоянку у мыса Жак. 28 декабря к "гибридам" присоединились "Асигара" и "Ойодо", которые до этого обстреляли американский плацдарм у Сан Хосе на острове Минданао. 30 декабря командованию Императорского флота стало ясно, что атаковать вражеский конвой не удастся и корабли были "оттянуты" в базы.
30 декабря 1944 года-1 января 1945 года флот совершил переход в Сингапур. По прибытии на базу флаг вице-адмирала Шимы был перенесен на крейсер "Ойодо". Вскоре крейсера ушли на ремонт на бывшую британскую военно-морскую верфь Солитер в Сингапуре. В этот же день "Исе" и ''Хьюга'' перевели в состав экспедиционных сил — началась подготовка к переходу в Японию.
12 января началась американская операция "Гратитьюд", целью которой было уничтожение прибрежного судоходства и береговых объектов противника. Палубная авиация атаковала все, что находилось в водах Индокитая, у Формозы и у Гонконга. Среди потопленных были и два японских танкера, предназначенных для кораблей в окрестностях Сингапура, и переход соединения отложили из-за нехватки топлива.
6 февраля "Исе" в составе соединения совершает переход из Линнга в Сингапур. Ему не повезло, он подорвался на мине, но повреждения были незначительными. С 6 по 9 февраля корабль кое-как "подлатали". В это же время на корабли, уходившие в Японию, грузили технику и принимали на борт войска и служащих.
На "Исе" было погружено 5206 бочек бензина (ещё 100 тонн было принято в цистерны), 1750 тонн олова, 1750 тонн каучука и 100 тонн прочих металлов, среди которых были даже цинк и ртуть. На корабле пришлось также разместить 550 специалистов-нефтяников.
Эскадра, в которую вошли "Исе", "Хьюга" и 4 эсминца, получила название "Завершающего соединения". Вечером 10 февраля состоялся выход в море, несмотря на нехватку топлива Командованием было принято решение постоянно держать в воздухе противолодочный патруль из гидросамолетов.
Вечером 10 февраля сигнальщики английской подводной лодки "Танталус" (капитан-лейтенант X. Макензи) обнаружили на горизонте пагодообразные надстройки японских линкоров. Сначала сближение проводилось в надводном положении, потом пришлось погрузиться. Лодка начала маневр выхода в атаку на шедшие противолодочным зигзагом вражеские корабли, но была обнаружена гидросамолетом, который сбросил на неё глубинные бомбы. Атака не удалась, и это был последний контакт британской субмарины с вражеским линкором.
13 февраля в 12 ч 13 мин японская эскадра была обнаружена американской подлодкой "Бергалл" (SS-320), которой командовал капитан-лейтенант Дж. М. Хайд. Погода была плохой, атаковать из подводного положения было невозможно, и ей пришлось погрузиться. Лодке удалось приблизиться на дистанцию 4400 метров и произвести шеститорпедный залп. Следы от торпед были обнаружены сигнальщиками эсминца "Хатсушимо", он предупредил эскадру. По приближавшимся смертоносным "сигарам" открыли огонь 127-мм орудия "Исе". Одна из торпед была взорвана, остальные прошли мимо. Японские эсминцы начали бомбить лодку, используя новые, более мощные, глубинные бомбы, но ей все же удалось скрыться.