По первоначальному проекту авиагруппа должна была состоять из 22 пикирующих бомбардировщиков "D4Y4" "Суисей" (американское кодовое название "Джуди"). Но к моменту возвращения в состав флота переоборудованных "Исе" и "Хьюги" их в наличии не было. Пришлось укомплектовать авиагруппу гидросамолетами "Е16А1" (американское кодовое название "Поль"). 24 августа 1943 года во время ходовых испытаний на борту "Исе" находились пикировщики "Айчи D3A1" (кодовое обозначение "Вэл").
Следует отметить, что большую часть службы линкоры-гибриды вообще не несли самолетов.
Одновременно усилили зенитную артиллерию. Так, по завершении работ на кораблях находилось 16 127-мм орудий (8 спаренных установок). Все спаренные 25-мм автоматы были демонтированы, их место заняли трехствольные автоматы. На момент завершения работ на борту кораблей их было 57. Обновили радиоэлектронное вооружение. Стандартное водоизмещение линкоров-авианосцев стало достигать 35350 т, полное 38676 тонн, длина 219,6 м. На испытаниях линкоры достигли скорости хода 25,3 узла.
В июне 1944 года вновь усилили зенитное вооружение кораблей — число 25-мм зенитных автоматов довели до 108 (31 трехствольный и 15 одноствольных). Тогда же на "Исе" и "Хьюге" появились новые радиолокационные станции. В конце 1944 года стало ясно, что новых самолетов для них нет и не будет, на полетной палубе установили 25-мм зенитные автоматы. Для увеличения углов обстрела средней группы башен главного калибра убрали катапульту.
Заложен 10 мая 1915 года на военно-морской верфи "Кавасаки" в Кобе, спущен на воду 12 (по другим данным, 2) ноября 1916 года, вошел в состав флота 15 декабря 1917 года. После прохождения испытаний и курса боевой подготовки стал флагманом 2-й дивизии линейных кораблей первого флота. Участия в боевых действиях не принимал. Первая модернизация состоялась в 1921 году — на линкоре установили 4 80-мм орудия.
В апреле 1922 года в японские воды пришел совершавший кругосветное путешествие линейный крейсер "Ринаун", на его борту находились наследник британского престола принц Эдуард и его родственник лорд Маунбаттен. "Исе" был кораблем-хозяином приема и удостоен высочайшего посещения. Затем для линкора началась рутинная служба: учения, маневры, стрельбы, редкие визиты в заграничные порты — в основном в китайские.
В 1929-1930 гг. на военно-морской верфи в Кобе была проведена первая модернизация. Объем работ был весьма небольшим, была изменена конфигурация носовой надстройки.
В июне 1934 года "Исе" стал флагманом международной эскадры, отдававшей последние почести победителю при Цусиме адмиралу X. Того. С 1 августа 1934 года по 23 марта 1937 года корабль проходит большую модернизацию на военно-морской верфи в Кобе. По завершении работ линкор поддерживал японские войска, воюющие в Китае. В октябре 1940 года "Исе" принимал участие в большом параде кораблей японского флота, которые прошли на рейде Иокогамы, в присутствии императора Хирохито.
1941 год прошел под знаком подготовки к войне.
7 декабря 1941 года "Исе" встретил в составе 2-й дивизии линейных кораблей Первого флота. Он вместе с остальными кораблями своего соединения находился на рейде Хасирадзимы. Но после получения информации об успехе нападения на Перл Харбор выходит в море, чтобы прикрыть возвращение авианосного соединения адмирала Нагумо. 13 декабря происходит торжественное возвращение соединения на базу.
В начале 1942 г. "Исе" стоит на рейде в полной боевой готовности, изредка выходя в море на учения и стрельбы. 5 марта 1942 года американские авианосцы адмирала Хэлси атаковали объекты на атолле Маркус. Из лагуны Трука на перехват вышли японские авианосцы, которые должны были перехватить их, если они продолжат движение к японскому побережью. 11 марта на поиск вражеских кораблей выходят "Исе" и "Хьюга", на следующий день они встречаются с крейсерами "Тама", "Кисо" и эсминцами охранения. Поиск оказался безрезультатным. 16 марта японские корабли прибыли в бухту Исе. 20-24 марта состоялся переход Исе-Хасирадзима.
18 апреля стартовавшие с авианосца "Хорнет" (CV 8) армейские бомбардировщики сбросили бомбы на Токио и еще несколько японских городов. С рейда Хасирадзимы в море вышли все линкоры 2-й дивизии, сопровождаемые 10 эсминцами. Поиск оказался безрезультатным, вражеские корабли не были обнаружены. Единственной их добычей стало советское торговое судно "Ангарстрой".
24 апреля "Исе" прибыл в Хасирадзиму.