Летом 1992 г. прошла серия совещаний лидеров коммунистических движений, на которых был создан координационный Российский совет коммунистических партий. На состоявшемся после длительного перерыва пленуме ЦК КПСС 13 июня 1992 г. Зюганова включают в состав группы лиц, уполномоченных представлять и отстаивать права КПСС на заседаниях Конституционного Суда РФ. Указ Б. Н. Ельцина о приостановке деятельности партии от 23 августа 1991 с Геннадий Андреевич всегда считал абсолютно неконституционным по самой своей сути. Он принял активное участие в знаменитом и историческом судебном процессе по делу КПСС, который проходил в Москве с 26 мая по 30 ноября 1992 г. Он не был главным свидетелем или руководителем делегации КПРФ, однако внес свой вклад в оправдание КПСС вместе с В. А. Купцовым, В. В. Калашниковым, И. И. Мельниковым, О. О. Мироновым, Ф. М. Рудинским, В. Д. Филимоновым, Ю. П. Ивановым, В. И. Зоркальцевым, Ю. М. Слободкиным, В. И. Севостьяновым, Б. П. Курашвили, В. С. Мартемьяновым, И. П. Осадчим и др.
Как представитель стороны КПСС и КП РСФСР Зюганов выступил на заседании Суда с большой речью политико-юридического характера. Она не была чисто юридической, но поскольку предмет анализа носил политический характер, да само право, как известно, есть «застывшая политика», то она была принята к сведению Конституционным Судом. Выступая официальным свидетелем, Зюганов, в частности, заявил: «В самом факте, когда бывшие члены КПСС, ее руководители, по сути, запретили и судят породившую их партию, есть нечто противоестественное, нечеловеческое. Ведь попирается извечная норма народной морали: дети своим родителям не судьи. Любопытно и то, что беспартийный адвокат Ю. Иванов защищает КПСС, а член КПСС А. Макаров выступает в роли главного обвинителя». Далее Зюганов обратил внимание на беспрецедентную логику обвинения — партия, чье правящее положение было закреплено в Конституции, оказывается неконституционной и не партией вообще, а государственной структурой. Но 40 млн человек, прошедших через партию, не признаются народом этого государства. Подчеркнув, что это извращение права, совести, логики, здравого смысла, Зюганов призвал судей учесть, что при таком подходе в незаконной партии состояли все командиры фронтов в войну, все главные конструкторы и директора заводов, более половины писателей и профессоров, большинство присутствующих на Суде. При коэффициенте семейственности 4,5 получается, что около 160 млн человек — большинство населения всей страны — причастно к якобы «преступной» организации. Это был убийственный аргумент. В самом деле — если преступна полугосударственная диктаторская партия, то и государство, народ, его населяющий, оказываются преступниками или активными соучастниками преступлений. Тогда кто кого судит?
Для более детального обоснования своих позиций Зюганов совершил экскурс в историю. Он подчеркнул, что стране, в которой 130 народов и народностей, 44 конфессии, нельзя заниматься пустой говорильней и радикальным экстремизмом. В США руководят формально 2 меняющиеся партии, а фактически это одна правящая элита. В России тоже длительное время управляла одна партия, и государство, ею руководимое, выдержало удар фашистской машины, быстрее всех восстановилось и к середине 60-х гг. стало супердержавой. Зюганов привел свидетельства Джанни Родари, сказавшего, что лучшее, что он видел в жизни, — это система дошкольного воспитания в СССР, и Генри Киссинджера, считавшего СССР самой крепкой державой в области человеческого духа. СССР производил треть мировой научной продукции, добывал 30 % мирового сырья, входил в пятерку самых безопасных и стабильных стран. мира. И «вина» КПСС в этом подъеме несомненна. Это признали США, когда в 1960 г. при участии президента Кеннеди запустили программу по разрушению КПСС и СССР. Зюганов привел выдержки из директивы Совету национальной безопасности США: 1) представить СССР как последнюю и самую хищную империю на земле; 2) доказать, что СССР не был архитектором победы, а является таким же злодеем, как фашисты; 3) с помощью гонки вооружений деформировать экономику и не позволить реализовать социальную программу; 4) разжечь национализм и в опоре на национально-религиозный экстремизм взорвать страну; 5) с помощью агентов влияния захватить средства массовой информации, разрушить коллективистский образ жизни, отрезать прошлое от настоящего, тем самым лишить страну будущего. Зюганов подчеркнул, что все сейчас наблюдают, как осуществляется эта программа. Но это все не означает, что партия безгрешна.
Зюганов признал, что бесспорная реальная вина партии заключалась в том, что она «осуществляла длительное время монопольное право на власть, растеряла опыт политической борьбы, реальные оценки обстановки и опору в массах», подчеркнув, что процесс демократизации КПСС обязана была начинать с самой себя. ЦК не хватило мужества освободить Горбачева с поста генсека, когда стали очевидны его полная несостоятельность в управлении страной и моральная нечистоплотность.