За все время войны самолеты F-117A выполнили 1271 вылет и сбросили более 2000 т бомб с лазерным наведением. Результативность (относительное число боевых вылетов с поражением назначенных целей) составила по официальным оценкам 80- 95% (в ходе войны во Вьетнаме результативность составляла в среднем 33%, к началу 1990-х годов нормой для самолетов обычных типов является 50%). Генерал-лейтенант Ч.Горнер, командующий ВВС многонациональных сил в зоне Персидского залива, выступая позднее на заседании в конгрессе США, заявил, что малозаметные самолеты, такие как F-117A и В-2, будут незаменимы в будущих локальных чрезвычайных конфликтах, аналогичных войне в Персидском заливе. Центральным моментом выступления Горнера стало сравнение двух рейдов против сильно защищенных иракских ядерных установок в Аль-Тувайте, что южнее Багдада. Первый рейд выполнялся днем, в нем приняли участие 32 самолета F- 16С с вооружением из обычных своподнопадающих бомб, под прикрытием 16 истребителей F-15C, четырех самолетов РЭБ EF-111, восьми противорадиолокационных самолетов F-4G и с привлечением 15 заправщиков КС- 135. Этой многочисленной авиационной группе (всего 75 самолетов) не удалось преодолеть сильную иракскую ПВО. Второй рейд проводился ночью восемью самолетами F-117A, каждый из которых нес по две корректируемых бомбы GBU-27 (калибр 907 кг) с лазерным наведением. К операции привлекались только два самолета-заправщика. «Невидимки» уничтожили три из четырех иракских ядерных реакторов. По мнению Горнера, такой же ущерб могли причинить за один вылет два бомбардировщика В-2, причем в этом случае заправщиков не потребовалось бы вовсе.
Об эффективности самолетов F-117A свидетельствовало также их успешное применение для поражения стратегических мостов на территории Ирака. По мостам безуспешно пытались нанести удары обычные самолеты – было выполнено более 100 боевых вылетов. Самолетам F-15, F-16 и F/ А-18 не удалось вывести из строя ни один из 42 стратегических мостов. За четыре дня до начала наступления сухопутных сил союзников, 17 самолетов F-117А в течение 27 минут нанесли удар по нефтепроводам. С помощью этих нефтепроводов в Багдаде рассчитывали осуществить заполнение нефтью заградительных рвов на территории Кувейта: из 34 целей «невидимки» поразили 32. На счету F-117 есть успешный в военно-техническом отношении удар, но сомнительный с точки зрения морали: разрушение бомбоубежища в Багдаде (13 февраля), которое американскими разведслужбами, якобы, было принято за командный пункт. В результате этой атаки погибло более 100 мирных жителей, что вызвало большой резонанс в мире.
При нанесении ударов самолетами F- 117А, как правило, не использовались самолеты РЭБ, так как постановка активных радиопомех могла привлечь внимание противника. В большинстве случаев при действиях самолетов F117A ближайший самолет союзников находился от них на удалении не менее 160 км.