Отношение Якова к Арабелле было двойственным. С одной стороны, он рассматривал ее как соперницу в борьбе за наследство Елизаветы. В то же время Арабелла была его ближайшей родственницей, и Яков неоднократно признавался, что испытывает к ней братские чувства. После восшествия на английский престол он пригласил леди Арабеллу ко двору. Видимо, личное знакомство с кузиной лишь укрепило доброе расположение к ней короля. Испытывая к Арабелле несомненную симпатию, король способствовал ее возвышению при дворе, а также старался всячески улучшить финансовое положение кузины. Арабелла получила ряд высоких должностей при дворе королевы Анны, жены Якова. Благодаря расположению к леди Арабелле королевской семьи вокруг нее стали активно группироваться многочисленные родственники и друзья, которые надеялись с ее помощью решить свои самые разные проблемы. Однако леди Арабелла больше не была игрушкой в руках родни, жаждущей власти. Отныне она являлась подлинным лидером нового придворного клана. Но был ли Рейли членом ее клана?
Сильные люди прошлого царствования внушали Якову тревогу: первой жертвой нового короля стал сэр Уолтер Рейли. «Отчего Его Величество столь холоден со мной?» – однажды поинтересовался Рейли у лорда Сесила. «Король не выносит табачного дыма», – ехидно ответил Сесил, который, как и все, знал, что именно Рейли привез из-за океана и ввел в английский обиход это растение. Хотя ему-то уж отлично была известна истинная причина неприязни короля: по сути, причиной этой и был сам Сесил – опасаясь влияния сильной личности Рейли на бесхребетного нового правителя, лорд Сесил заранее позаботился о том, чтобы очернить сэра Уолтера в его глазах. Впрочем, Рейли и сам стал допускать тактические ошибки, вернее, так могло показаться со стороны. Например, он подал королю «Записку касательно войны с Испанией и защиты Нидерландов». Мог ли Рейли не знать, что в отличие от Елизаветы Яков всячески стремился заключить с Испанией мир? Вне всякого сомнения, Рейли это было известно, однако он не счел возможным угодливо соглашаться с монархом в том, что он лично считал неприемлемым и вредным для английской империи.
Весть о том, что сэр Уолтер Рейли – фаворит покойной королевы Елизаветы I, авантюрист и герой – заключен в Тауэр по обвинению в государственной измене, мгновенно облетела Лондон, вызвав недоумение горожан: патриот Рейли и государственная измена в их понимании сочетались плохо. Против него выдвинули притянутое за уши обвинение: якобы он замышлял посадить на трон Арабеллу Стюарт. Благодаря стараниям своих недругов Рейли, оказавшийся в полной немилости при дворе, несомненно, знал о существовании заговоров, хотя в них не участвовал и не пользовался доверием конспираторов. После ареста заговорщиков Роберт Сесил убедил одного из них, некоего Кобхема (и, кстати, своего близкого родственника), в том, что именно Рейли предал его, и побудил сделать признания, продиктованные «коварным искусителем». Но так как Кобхем неоднократно менял свои показания, то его свидетельства потеряли всякую ценность.
Судебное слушание по делу о государственной измене было назначено на 17 ноября 1603 года. Отлично сознавая шаткость улик против Рейли, Тайный совет строго подошел к отбору судей, большинство которых были заклятыми врагами обвиняемого. Враги Рейли довели до сведения короля, что тот активно выступал против восшествия на трон Якова. Против Рейли были выдвинуты четыре обвинения: стремление низвергнуть короля Якова I и посадить на трон его кузину Арабеллу Стюарт; подстрекательство к восстанию в королевстве; организация заговора с целью возвратить католической церкви ее былые позиции и организация испанского вторжения в Британию. Все это было очевидной выдумкой от начала до конца.
Рейли, который в припадке отчаяния еще до суда пытался покончить жизнь самоубийством в Тауэре, теперь снова обрел свое обычное самообладание. Обвинители неистовствовали, угрожая подсудимому пытками, именовали его «гадюкой», «гнусным и отвратительным предателем», «исчадием преисподней», «чудовищем с английским лицом, но испанским сердцем». После всего лишь 15-минутного совещания присяжные вынесли вердикт о виновности. Главный судья сэр Джон Попем, не колеблясь, объявил приговор: Рейли должен быть повешен, но затем еще живым вынут из петли и четвертован, «ваша голова будет отсечена от туловища, а тело будет расчленено на четыре части, чтобы таким образом покончить с вами по распоряжению короля – и да простит Господь вашу грешную душу!» Часть присяжных, потрясенных тем, как мужественно Рейли вел себя на суде, на коленях умоляли подарить подсудимому жизнь. Явное изменение настроения публики в пользу подсудимого заставило трусливого Якова, не отменяя смертного приговора, обречь Рейли на долголетнее тюремное заключение в Тауэре, где он написал свою многотомную «Всемирную историю». Уже на эшафоте были помилованы еще три участника заговора.