Генерал-майор Эдвард Джонсон с 3 000 человек прикрывал Стаунтон от возможного нападения генерала Р. Х. Милроя с передовым отрядом армии генерала Фремонта на Виргинскую центральную железную дорогу, и инстинкт Стоунволла Джексона совпал с инстинктом Ли - ранний пример того, как слаженно работают их умы. 1 мая Джексон, никого не предупредив о своих намерениях, отделил своих людей и двинулся маршем через брешь в горах Блю-Ридж, а затем в Стонтон, чтобы присоединиться к Джонсону. Вместо того чтобы последовать предложению Ли и "притянуть" Джонсона к себе на север, Джексон быстро двинулся на юг, чтобы присоединиться к нему. Это было типично для Джексона. Он просто исчез вместе со своей армией, и его местонахождение осталось загадкой как для Ли в Ричмонде, так и для Бэнкса в Харперс-Ферри. Это был первый шаг в знаменитой "кампании в долине" Джексона, серии быстрых маршей, контрмаршей и атак, проведенной настолько успешно, что она вошла в учебную программу всех крупных штабных колледжей мира. Британский военный историк генерал-майор Дж. Фуллер в своей чрезвычайно влиятельной книге "Основы военной науки", опубликованной в 1926 году, жаловался - хотя он и был горячим поклонником Джексона, - что студенты британского штабного колледжа заучивали все о кампании в Долине до тех пор, пока не могли пересказать, что Джексон ел на завтрак в каждое утро этой кампании, В то время как в германских штабных колледжах кампания Джексона в долине изучалась с гораздо большим интеллектуальным любопытством и воображением и стала основой для блицкрига - молниеносного использования брони, механизированной артиллерии и мобильной пехоты для прорыва линии противника, нанесения сокрушительного удара, а затем исчезновения на одну ночь, чтобы нанести новый неожиданный удар в другом месте.
Усталые, измученные пехотинцы Джексона с гордостью называли себя "пешей кавалерией" за скорость, с которой они преодолевали дороги, хорошие и плохие, в Долине. Они создали, как и предвидел Ли, новый вид войны, который Фуллер очень метко назвал "электрической кампанией" и который и сегодня служит примером для каждого генерала, желающего избежать опасностей, связанных с принуждением к занятию фиксированных позиций. Решение Джексона заключалось в том, чтобы вести войну, в которой скорость важнее, чем превосходство в численности.
Через неделю после того, как он исчез в горах Голубого хребта, Джексон появился вновь, чтобы присоединиться к небольшому отряду генерала Джонсона из 3 000 человек перед Стонтоном, что в общей сложности составило почти 10 000 человек. Затем он разбил генерала Милроя у деревни Макдауэлл 8 мая - дневное сражение, которое началось с атаки союзников и закончилось победой конфедератов. После этого Джексон совершил марш-бросок почти на шестьдесят миль на север. Его планы были временно отложены попыткой генерала Джонстона приказать Юэллу отступить к Ричмонду со своими 8000 человек, которую Джексон быстро пресек прямой мольбой к Роберту Э. Ли, вмешавшемуся в его планы. Собрав 17 000 человек, он одержал крупную победу при Фронт-Ройяле 23 мая, а 25 мая вновь захватил Винчестер, в результате чего армия Бэнкса в хаосе отступила через Потомак. К концу месяца кавалерия Джексона угрожала Харперс-Ферри. Это было выдающееся достижение: "В классической военной кампании неожиданности и маневра он заставил свою армию пройти 646 миль... ...за сорок восемь дней... и [одержал] пять значительных побед с численностью около 17 000 человек против объединенных сил численностью более 50 000". Даже имея численность три к одному, Джексон раз за разом умудрялся избегать окружения, проводя свою армию через бреши в горах, а затем вверх или вниз по дорогам долины, чтобы снова вступить в бой, причем всегда на выбранной им самим местности. Джексон также не позволил 40 000 человек соединиться с войсками Макклеллана на полуострове - именно то, что Ли планировал с самого начала.