1963 год принес авианосцам два новых испытания: советские облеты и изучение «стоимости-эффективности» министра обороны МакНамары. Начиная с конца января, Советы начали серию интенсивных облетов американских авианосцев дальними разведывательными самолетами. С 27 января по 27 февраля авианосцы «Констеллейшн», «Энтерпрайз», «Форрестол», «Китти Хок» и «Принстон» подверглись облетам советских самолетов, которые проводились в обоих океанах. «Констеллейшн» был осмотрен советскими самолетами в 600 милях к югу от острова Мидуэй, «Форрестол» — к юго-западу от Азорских островов. Все это происходило в нейтральных водах. Корабельный радар обнаруживал ищеек в 200 милях от корабля. Истребители «Фантом» и «Крусейдер» сопровождали советские самолеты, пока они находились вблизи от ударных авианосцев. В некоторых случаях самолеты американских ВВС сопровождали советские самолеты и на некоторых участках полета от их баз в СССР.
Министр обороны МакНамара сообщил прессе об этих облетах 28 февраля 1963 года, заметив, что не видит оснований для беспокойства, и сказав, что любая страна имеет право фотографировать корабли в нейтральных водах. Моряки сразу заявили, что корабли следовали обычным курсом, о котором объявлялось заранее, и не пытались сохранять радиомолчание. Вице-адмирал Уильям А. Шойх, заместитель начальника штаба ВМФ по воздушным операциям, заявил, что Советы имели двоякую цель: подорвать уверенность американского народа в авианосцах как ударной силе, и убедить советский народ в том, что авианосцы устарели, и таким образом оправдать их отсутствие в советском флоте. Совершенно ясно, что такие облеты должны были обеспечить советским летчикам тренировку в условиях, приближенных к боевым.
В июне «Рейнджер» стал шестым американским авианосцем, подвергшимся облету. 6 реактивных бомбардировщиков пролетели рядом с кораблем, когда он шел в 330 милях к востоку от Японии. В 1963 году советские самолеты совершили 14 облетов американских авианосцев. В 1964 году количество облетов упало до 4. Советы вернулись к более реалистичной практике посылки нашпигованных электроникой траулеров и эсминцев для преследования американских авианосцев во время учений флота. Однако в последние годы советские самолеты регулярно пролетают над американскими авианосцами. В 1968 году, когда турбореактивный Ту-16 «Бэджер» пролетал рядом с «Эссексом», крыло самолета коснулось воды, он разбился и сгорел. В это время противолодочный авианосец действовал у норвежского побережья. Корабль повреждений не получил.
Более серьезному испытанию авианосцы подверг МакНамара. На 1964 финансовый год не была утверждена постройка ни одного ударного авианосца. Представляя конгрессу оборонный бюджет 30 января 1963 года, МакНамара заявил: «В порядке эксперимента каждые 2 года будет закладываться 1 ударный авианосец с обычной машинной установкой. Последний такой авианосец был включен в бюджет 1963 финансового года (CVA-67), поэтому следующий будет заложен в 1965 году, а очередной — в 1967 году».
Затем 22 февраля 1963 года МакНамара потребовал, чтобы флот представил обоснования содержанию в строю 15 ударных авианосцев и строительству новых. Он подверг аргументы анализу, сравнивая корабли с базовой авиацией на основе критерия «стоимость-эффективность». Ударные авианосцы не имели первостепенной важности в американских стратегических наступательных программах, так как резко увеличилось количество баллистических ракет. К середине 1963 года уже имелось более 400 баллистических ракет с ядерными боеголовками, в том числе 144 ракеты «Полариса» на 9 атомных подводных лодках. К концу года предполагалось иметь почти 600 ракет.
Вице-адмирал Шойх был назначен начальником секции изучения эффективности авианосцев, а контр-адмирал Тэрнер Ф. Колдуэлл стал начальником секции изучения эффективности морской ударной авиации. Они должны были оправдать содержание 15 (или более!) ударных авианосцев. Контр-адмирал Джон Б. Колвилл возглавил секцию изучения эффективности корабельных атомных машинных установок, в том числе и авианосных.
В начале 1962 года военно-морской министр и начальник штаба ВМФ запросили средства на постройку в 1963 финансовом году авианосца с обычной машинной установкой, так как выяснилось, что атомный авианосец будет на 1/3 – ½ дороже. Кроме того, они чувствовали, что требуется время, чтобы полностью оценить характеристики первых атомных кораблей (авианосец «Энтерпрайз» и крейсер УРО «Лонг Бич», вошедшие в строй в 1961 году). Основываясь на опыте действий этих кораблей, в 1963 году флот выдвинул предложение, чтобы CVA-67 и вообще все военные корабли водоизмещением более 8000 тонн получили атомную машинную установку.