Проигранная битва авианосцев и падение Сайпана стали ударом для японского правительства и японского народа. Сайпан не был территорией, захваченной в ходе войны. Этот остров являлся частью довоенной империи. Японцы получили новый сильнейший удар, когда 48 тяжелых бомбардировщиков В-29 «Сверхкрепость» бомбили сталелитейный центр Явата на юго-западе Японии. Бомбардировщики, вылетевшие с китайских аэродромов, причинили мало вреда, но сам факт налета, первого со времен рейда Хэлси-Дулитла в апреле 1942 года, оказал большое психологическое воздействие на японское верховное командование и на народ. Захват Сайпана и создание там аэродромов ставили большую часть Японии в пределы досягаемости В-29. После морского сражения, пока еще шли бои на Сайпане, часть японских официальных лиц начала искать пути дипломатического завершения войны. 18 июля, в день, когда в Японии было официально объявлено о падении Сайпана, правительство Хидэки Тодзио ушло в отставку. Потеря Сайпана и отставка Тодзио оказали большое влияние на среднего японца, ведь ему продолжали втолковывать, что каждый бой, каждое самое мелкое столкновение завершаются победой японцев.
Среди военных, особенно среди моряков, больше не было непоколебимой уверенности в конечной победе. Большинство высших флотских офицеров считало, что Мидуэй и Гуадалканал стали поворотными пунктами в ходе войны. Сайпан был потерян, когда перелом уже совершился. Те, кто после Мидуэя еще надеялся изменить характер войны, теперь поняли, что нанести поражение союзникам теперь не удастся. Вице-адмирал Сигеру Фукудомэ, начальник штаба Объединенного Флота, в середине 1944 года отмечал:
«Я точно знал, что если эта линия <Марианские острова – Палау> однажды будет прорвана, то нашу оборонную мощь восстановить уже не удастся... Если эта линия будет прорвана, уже не останется шансов на успех в дальнейшем. Потеря Марианских островов стала для меня тяжелым моральным ударом. Я никогда не имел плана обратного захвата Марианских островов и не имел уверенности, что это вообще возможно. Но хотя потеря Марианских островов стала для меня тяжелым моральным ударом, она не подорвала моего желания сражаться, так как с самого начала я был полон решимости драться до последней капли крови. Это лишь означало, что я больше не видел шансов на успех».
Начальником авиационного отдела штаба Объединенного Флота во время боя у Марианских островов служил капитан 1 ранга Мицуо Футида, который командовал первой волной японских самолетов во время налета на Пирл-Харбор. После войны он сказал, что операция А-ГО «должна была стать решающей, потому что все мы чувствовали: если Марианские острова будут потеряны, мы не сумеем удержаться и на Филиппинах».
Марианские острова впоследствии
После отмененной погони за Первым мобильным флотом Оперативное Соединение 58 вернулось к Сайпану и днем 22 июня встретилось с танкерами. Заправка была закончена на следующий день, после чего соединение разделилось. Адмирал Спрюэнс повел крейсера и эсминцы, одолженные у десантного соединения, к Сайпану. Адмирал Митчер увел 3 оперативные группы на Эниветок для отдыха. Только Оперативная Группа 58.1 контр-адмирала Кларка («Хорнет», «Йорктаун», «Батаан» и «Белло Вуд») после заправки пошла на север к Титидзиме и Иводзиме. Кларк перед боем уже нанес удар по этим островам силами 7 авианосцев, а теперь возвращался, чтобы уничтожить японские самолеты, которые делали остановку на этих островах по пути на Тиниан и Гуам в группе Марианских островов.
Утром 24 июня «Хорнет», «Йорктаун» и «Батаан» на расстоянии 235 миль от Иводзимы и Титидзимы подняли 51 «Хеллкэт», каждый из которых нес 500-фн бомбу. Самолеты «Белло Вуда» вели противолодочное патрулирование и прикрывали соединение от воздушных атак.
Плохая погода вызвала скопление японских самолетов на этих двух островах. Они ожидали улучшения погоды, чтобы лететь дальше. Там находились 122 самолета, половина из которых была авианосными истребителями. Патрульный самолет предупредил о приближении американских самолетов, и японцы подняли на перехват все истребители и часть бомбардировщиков.