Примерно посередине между кормовым срезом корпуса и ограждением рубки установили один механизированный контейнер, перед пуском поднимающийся на угол 15’. Устройства крепления и подъема контейнера были выполнены весьма основательно, с явно избыточным запасом, что было вполне оправдано: впервые крылатая ракета стартовала с отечественной лодки с людьми на борту Старт производился по ходу лодки, и самолет-снаряд пролетал над ограждением рубки В прочном корпусе, в основном в первом и третьем отсеках, установили аппаратуру предстартового контроля и пуска, комплексную систему управления стрельбой и ряд других средств Вместо гирокомпаса «Курс-3» разместили комплексы навигационных приборов «Сила-Б» и «Сила-В», а механический лаг ГОМ-III заменили на гидродинамический лаг «Бурун ». В шестом отсеке смонтировали гидравлику подъема контейнера. Все это оборудование обеспечивало отработку комплекса в достаточно полном объеме и использовалось и при проведении государственных испытании.
Для частичной компенсации дополнительных грузов с лодки сняли стеллажи с запасными торпедами, торпедопогрузочное устройство и артиллерийское вооружение. Впрочем, пушки, весящие 7.5 т. так или иначе снимались со всех лодок в соответствии с правительственным решением начиная с 1956 г. В результате водоизмещение и осадка возросли незначительно: с 1080 до 1089 т и с 4,55 до 4.6 м соответственно. В связи с опытовым назначением лодки сочли допустимым уменьшение автономности с 30 до 20 суток, экипажа – с 52 до 37 человек. За счет дополнительного сопротивления контейнера максимальная под водная скорость упала с 13,1 до 11.5 узла.
Для подготовки к старту лодке требовалось своевременно получить данные о своем местонахождении и азимутальной ориентации Для решения этой задачи предусматривалось оснастить ее астронавигационным перископом «Лира» Но разработка нового оптического прибора затянулась, и на С-146 его не установили.
В октябре переведенная в Северодвинск лодка была готова к проведению первого пуска Вся страна готовиласьотметить сороковую годовщину Октября. Но подарка к празднику не получилось, хотя 1 и 2 ноября вышедшая в море лодка готовилась к пуску Подвели короткие замыкания, возникавшие в местах соединения корабельных кабельных трасс системы управления комплекса со штепсельными разъемами на пультах предстартовой подготовки и проведения старта, выполненными по авиационному образцу.
После устранения неполадок уже после праздников лодка вышла в Белое море и, несмотря на неблагоприятные погодные условия, днем 22 и в ночь с 29 на 30 ноября выполнила пару успешных пусков. Уровень акустического воздействия от струй двигателей в прочном корпусе оказался на допустимом для личного состава уровне, единственным нанесенным ущербом оказались кормовые аварийно-спасательные буи, снесенные при пуске.
Вскоре Белое море сковали льды, но в Капустином Яре приступили к новым видам испытаний со специального стенда, имитирующего качку лодки. По тем временам было даже странно, что пусковая установка не стабилизировалась по крену Тем не менее самолет-снаряд летел вполне устойчиво, гироскопические приборы не подвели.
В 1958 г. во время посещения полигона Капустин Яр Первым секретарем ЦК КПСС и Председателем Совета Министров СССР Н С Хрущевым среди прочих достижений ему продемонстрировали старт самолета-снаряда П-5 с экспериментальной наземной пусковой установки.
Помимо нештатного наземного старта в то время уже прорабатывался вариант ракетного комплекса П-5П для применения в качестве оперативно-тактического вооружения Сухопутных войск. Военно-воздушные силы также заинтересовались ракетой П-5. Соответствующий вариант проектировался под индексом П-5Н (П-5НА) и был представлен новому заказчику в эскизном проекте, выпущенном в июле 1958 г К работе над системой управления подключили ОКБ-283 Но, несмотря на планировавшуюся постройку 10 опытных П-5НА на саратовском заводе №292, работы не получили продолжения Вскоре на вооружение авиации поступил микояновский самолет-снаряд Х-20, специально предназначенный для вооружения Ту-95К (ракетоносной модификации Ту-95) и обеспечивающий лучшую точность за счет применения радиокоррекции полета с самолета-носителя.