Центральное разведывательное управление стремится расколоть прогрессивные религиозные организации Латинской Америки. В докладе американскому правительству ЦРУ выразило серьезную озабоченность в связи с тем, что «в некоторых латиноамериканских странах церковь по-новому стала подходить к социальным проблемам». Выходящая в Боготе газета «Боготано» в марте 1977 г. так писала о планах ЦРУ в отношении церкви. ЦРУ считает, что его представители в Латинской Америке, занимающиеся церковными вопросами, должны руководствоваться следующими указаниями: не допускать нападок на церковь и на отдельных епископов, поддерживать хорошие отношения с церковной иерархией; прогрессивных священников изображать агентами международного коммунизма, запугивать и дискредитировать их; устанавливать полицейский контроль над религиозными общинами и прогрессивными деятелями церкви; проводить кампанию по дискредитации некоторых религиозных деятелей; снабжать священников пропагандистскими материалами и оружием. В Колумбии, как отмечала «Боготано», это нашло отражение в нападениях на священников, принимавших участие в выступлениях народных масс. Свои планы ЦРУ осуществляет при помощи организации «Рэнд корпорейшн» со штаб-квартирой в калифорнийском городе Санта-Моника.
Руководитель центрального разведывательного управления Кольби и представитель Белого дома были вынуждены сделать заявление, в котором признали, что американские миссионеры использовались для сбора информации. Они признали факт сотрудничества между американскими миссионерами и ЦРУ, заявив при этом, что не были нарушены ни закон, ни интересы миссии. Речь идет о протестантских и католических миссионерах, которые действуют за пределами США. В другом заявлении, сделанном по поводу связей ЦРУ с миссионерами, представитель Белого дома также вынужден был признать, что многие священники-миссионеры заняты разведывательной деятельностью.
С ЦРУ был связан и бельгийский иезуит Векеманс, который организовывал выступления против левых групп христиан Чили. В зарубежной печати опубликованы материалы о «совместных делах» этого солдата «черной гвардии» Ватикана и ЦРУ. Векеманс выполнял поручения руководителей ЦРУ и в 1963 г. получил 5 млн. долларов для поддержки антикоммунистических профсоюзов и Латинской Америке. В свое время он встречался с президентом Кеннеди, директором ЦРУ Джоном Макконе и директором так называемого «корпуса мира» Сарджентом Шривером.
В деятельности американских религиозных организаций большое место занимают проблемы войны и мира. Церковные иерархи США поддерживали воинственные устремления американских империалистов. Они оправдывали агрессивные акции американской военщины.
Католическая иерархия США прилагала огромные усилия к тому, чтобы не допустить включения в документы Второго Ватиканского собора пункта об осуждении ядерного оружия. Епископ Хеннен требовал, чтобы собор отклонил те параграфы пастырской конституции «Гаудиум эт спес» («О церкви в современном мире»), в которых говорится о необходимости отказа от ядерного оружия и осуждаются бактериологические и химические средства ведения войны.
На IV сессии собора в 1965 г. американские епископы призывали соборных отцов голосовать против пятого раздела проекта пастырской конституции «О церкви в современном мире», посвященного проблемам войны и мира. Однако собор утвердил эту конституцию, потому что не мог не учитывать того, что в борьбе за мир принимали активное участие миллионы верующих.
Католические иерархи вынуждены были пересмотреть свое отношение к проблеме войны и мира. Новая линия папского престола была изложена в энциклике папы Иоанна XXIII «Пацем ин террис» («Мир на земле», 1963), в которой глава католической церкви выступил за запрещение ядерного оружия, разоружение под эффективным международным контролем, мирное сосуществование государств с различным социальным строем, мирное урегулирование спорных международных вопросов. Новая позиция Ватикана явилась результатом реалистической оценки им изменившегося соотношения сил в пользу социализма. понимания всей бесперспективности военной конфронтации капиталистических стран с социализмом. Изменение позиции Ватикана связано с эволюцией католицизма, с процессом обновления католической церкви и приспособления ее к современной эпохе.
Руководители американских религиозных организаций, тесно связанные с правящими кругами, долгое время выступали против политики мирного сосуществования государств с различным социальным строем, мотивируя свою позицию тем, что христиане якобы не могут мирно сосуществовать с государствами, в которых господствует атеизм. Наиболее рельефно позицию американских церковников — противников политики мирного сосуществования государств с различным социальным строем выразил архиепископ Нью-Йорка кардинал Спеллман. Выступая в американской военной академии в Вест-Пойнте, он призывал «не дать себя поймать на удочку опиума мирного сосуществования».