Инфекционные заболевания стали причиной совершенно разных результатов. Колонизация Америки стала возможной только потому, что на помощь конкистадорам пришли патогенные микроорганизмы Старого Света. Португальцам не повезло. Побережье Западной Африки было связано с остальной Европой и Азией транссахарскими торговыми путями. Куда путешествовали люди, туда же попадали бактерии и вирусы. Поэтому люди, жившие вдоль этих путей или вблизи портов, должны были выработать иммунитет к инфекционным заболеваниям, которые были распространены в Европе. Но Африка в то время отличалась от Европы в одном ключевом отношении: она была относительно малонаселенной. Многие люди в глубине Африки жили изолированными общинами - они не подвергались воздействию патогенов Старого Света и поэтому не выработали устойчивость. Такие болезни, как оспа, корь и грипп, могли бы представлять опасность для этой последней группы, если бы только европейцы могли путешествовать по всему континенту. Но болезни, переносимые комарами, сделали это практически невозможным.
Западная Африка была и остается чрезвычайно благоприятной средой для двух инфекционных заболеваний, переносимых комарами. Plasmodium falciparum вызывает самую смертоносную форму малярии. Он может размножаться внутри самки комара только в том случае, если температура воздуха в течение трех недель превышает 20 градусов Цельсия. Когда погода становится жарче, цикл ускоряется. Малярия фальципарум процветает в тропическом климате. Комары Anopheles gambiae откладывают яйца в стоячую воду, а ее много в сырой и влажной Западной Африке. Поэтому малярия была настолько распространена в Западной Африке, что избежать укусов зараженных комаров Anopheles было практически невозможно. Врожденный иммунитет не обеспечивает практически полной защиты. Даже сегодня малярия ежегодно убивает сотни тысяч людей в странах Африки к югу от Сахары, большинство из которых - маленькие дети, впервые столкнувшиеся с болезнью. Те, кто не умирает в детстве, могут повторно заразиться и стать носителями плазмодия, но по мере развития сопротивляемости организма редко проявляются какие-либо симптомы, кроме слабых. Таким образом, малярия является относительно безобидным заболеванием для взрослых, которые всю жизнь прожили в Западной Африке. Напротив, Plasmodium falciparum смертельно опасен для взрослых, которые не выросли в эндемичном регионе, и значительная часть будущих европейских поселенцев погибала от малярии вскоре после прибытия.
Желтая лихорадка также распространена в Западной Африке, но эпидемиологическая динамика отличается. В детском возрасте вирус, как правило, не смертелен, а после одного заражения у вас вырабатывается пожизненный иммунитет, и вы больше никогда не сможете стать хозяином для возбудителя. Но желтая лихорадка - очень серьезное заболевание для взрослых. Жертвы страдают от массивного внутреннего кровотечения. Кровь скапливается в желудке и сворачивается в черную слизь, которую затем вырывает. Желтой лихорадкой это заболевание называют потому, что одним из симптомов является желтуха, при которой кожа, разумеется, становится желтой. Примерно треть заболевших умирает. В отличие от малярии, вирус желтой лихорадки может сгореть в определенном районе, когда там больше нет достаточного количества неиммунных тел для заражения. Но он возвращается снова, когда появляется достаточное количество новых детей или иммигрантов для поддержания новой эпидемии. Несмотря на различия между малярией и желтой лихорадкой, результат с точки зрения европейцев был одинаковым: они погибали в ужасающих количествах, в то время как взрослое население Западной Африки оставалось незатронутым.
Тот факт, что попытки европейцев заселить Америку провалились без помощи инфекционных заболеваний, наводит на мысль, что португальцам пришлось бы нелегко в колонизации Западной Африки, даже если бы малярия и желтая лихорадка не пришли на помощь коренному населению. Но эти болезни, переносимые комарами, создали защитное силовое поле, которое сделало военное завоевание практически невозможным. Писавший в XVI веке Жуан де Баррош, историк, которого называют "португальским Ливием", ярко описал разочарование будущих колонизаторов:
Но кажется, что за наши грехи или по какому-то непостижимому Божьему суду у всех входов в эту великую Эфиопию, по которой мы плаваем, Он поставил поражающего ангела с огненным мечом смертельной лихорадки, который не дает нам проникнуть внутрь, к источникам этого сада, откуда текут эти золотые реки, впадающие в море в стольких местах нашего завоевания.