События «Сицилийской вечерни» послужили предлогом для начала войны с Францией. Тогда папа Мартин IV (1281–1285) низложил арагонского короля Педро III с престола и освободил от клятвы верности его вассалов и подданных. Папа передал арагонскую корону французскому принцу и призвал к крестовому походу на Арагон 1. Начались новые кровопролитные сражения и, хотя все побережье Арагона было предано огню, тем не менее и папско-французский флот и совместная армия были уничтожены. В это время умирает король Филипп III, немедленно заключается мир, по которому Неаполитанское королевство распадается на две части — Сицилию, доставшуюся Арагону, и Южную Италию с Неаполем, оставшуюся в руках французов.
При понтификате папы Николая IV (1288–1292), который до своего избрания был кардиналом Палестины и папским легатом на Ближнем Востоке, пали последние крепости, находившиеся в руках христиан в Палестине и Сирии. В 1292 году Николай IV умирает, и тут папский престол остается незамещенным (в Церкви это положение обозначается термином «sede vacante»). Два года кардиналы, собравшиеся в Перудже, не могли договориться о кандидатуре нового главы Церкви. С одной стороны, Церковь, отягощенную политическими противоречиями, раздирали различные мистические и апокалипсические ожидания, которые охватили все слои европейского общества накануне приближающегося начала нового столетия. С другой стороны, на собравшихся кардиналов оказывали огромное давление как представители двух соперничавших родов Орсини и Коллонн, так и король Неаполя Карл II Анжуйский.
Тем временем в 1294 г. французский король вступает в войну с Англией и для покрытия расходов вводит специальный налог, который распространяет и на духовенство.
В том же 1294 году окончилось наконец положение «sede vacante», папский кризис. Карл Анжуйский привозит к выборщикам 72-летнего монаха Пьетро Анджелари дель Мурроне, пользовавшегося большим почетом, подвизавшегося в качестве отшельника в местечке Сьельмоны, недалеко от Неаполя. Выбор был навязан. Новый папа принял имя Целестина V. Немедленно по восшествии на престол, он решил принять участие в судьбе госпитальеров. Но его старания не увенчались успехом.
Вскоре при загадочных обстоятельствах он неожиданно подписал отречение от папского престола и ушел в отставку, которая была немедленно принята коллегией кардиналов. Историки церкви утверждали, что протокол отставки составил будто бы кардинал Бенедетто Каэтани, враг рода Колонна. Именно этот человек и стал затем следующим 191 папой с именем Бонифаций VIII (1294–1303). Он настолько ненавидел своего противника, что тут же заключил его под стражу и заставил стражников издеваться над стариком. Целестин V умер в 1296 г. в крепости, но уже в 1313 году был провозглашен святым.
Характер у Бонифация VIII был отвратительным, он был злобным, завистливым человеком, очень злопамятным, занятым только своим возвеличением. Он немедленно начал борьбу не только против своего предшественника, но и против французского короля Филиппа IV Красивого. Три его буллы содержали программу укрепления папской власти. В первой «Clericis laicos» он резко выступил против фискальной политики короля, запретил обложение духовенства без разрешения курии. В ответ на это король запретил вывоз из Франции золота, серебра и всяких драгоценностей за границу.
Но уже через год, в 1297 г., во второй булле «Romana Mater» папа вынужден был смягчить свои угрозы. В ней папа писал: «Мы даем разрешение отдельным духовным представителям во Франции добровольно платить, и в чрезвычайных случаях не будем настаивать на своем разрешении» 1. А вскоре Бонифаций VIII нашел способ получения доходов. Он объявил 1300 год «святым годом», объявив, что всякий грешник, прибывший в Рим на 15 дней и ежедневно посещающий храм св. Петра и Павла, не только получает прощение, но и приравнивается к крестоносцу, пользующемуся особыми милостями церкви.