Как уже отмечалось, вопреки мощи миграционного напора арьев на Европу, они радикально не изменили генетического портрета, устоявшегося со времен верхнего палеолита. Послеледниковые и неолитические родословные (судя по изучению с помощью Y-хромосомного полиморфизма) составляют лишь мужского 20 % генофонда Европы, будучи близкородственными ему. Соответственно, миграционный вклад в расовое разнообразие оказался достаточно слабым. Происходило смешение именно с близкородственным населением. Арии-завоеватели имели близкий к европейским племенам генотип — те и другие несли в себе те же древние гены. Нет сомнений в том, что арии объединили на своей прародине население, вытесненное из Восточной Европе последним ледником — реконструкции облика древнейших кроманьонцев Восточной Европы показывают поразительное сходство с ариями.
Очень далекими от «спора славян между собою» оказались те мигранты африканской проторасы, которые тысячелетиями перемещались по ландшафтам Южной и Юго-Восточной Азии. Их дальнейшая миграция на север со временем отбросила арийских колонистов («рыжеволосых ди» и тохаров) на северо-запад, устраивая при этом страшные расовые чистки и мстя аристократическим сословиям за свое униженное положение в социальной пирамиде. В условном пограничье тех времен остались упорно не поддающиеся вымыванию остатки соответствующих генотипов, которые наблюдаются в некоторых сибирских народах, а также в загадочных айнах.
Крито-микенская (эгейская) культура относится к III–II тыс. до н. э. и была распространена в материковой Греции, на островах Эгейского моря, на острове Крит и в Малой Азии (Анатолийское побережье). Троя также отмечена признаками крито-микенской культуры.
Около 2300 до н. э. Пелопоннес и северо-западная Анатолия подверглись нашествию, о чём свидетельствуют следы пожаров и разрушения на поселениях, что привело к значительному изменению материальной культуры. Лишь на острове Крит развивалась минойская культура. В начале II тыс. до н. э. бурно расцветает среднеминойская цивилизация, строятся дворцы в Кноссе, Фесте, Малии, Арханах, Закросе и Кидонии. Критские мореплаватели создают колонии Мелос и Киферы, ведется торговля с Кипром, Египтом и Сирией, появляется иероглифическое письмо. Минойцы переживают страшное землетрясение около 1700 г. до н. э., но быстро восстанавливают свою цивилизацию в прежнем блеске.
Материковая Греция около 1600 года до н. э. подверглась нашествию (вероятно, ахейскому), в котором зафиксировано использование боевых колесниц. В результате образовались новые городские центры — Микены, Тиринф, Орхомена. Вместе с ахейцами на Крите появилось линейное (преимущественно слоговое) письмо. На смешанность населения (возникшее также в результате нашествия) указывает затруднение с дешифровками группы критских надписей, которые считаются не принадлежащими к индоевропейской группе языков. Материковая крито-микенская цивилизация гибнет в результате дорийского нашествия примерно на рубеже 13–12.
Примерно в 1470–1450 гг. до н. э. (данные, полученные при исследовании следов пепла в ледниках обозначают на век-полтора более раннюю дату) минойская цивилизация разрушена извержением вулкана на Фере (о. Санторин) — катастрофой планетарного масштаба. Пользуясь моментом, ахейцы захватывают Крит. Около 1100 г. до н. э. Крит захватывают дорийцы, вводя новые культы и порядки — строгий закон и спартанскую дисциплину. Были введены трупосожжение и греческий пантеон богов. Прежнее минойское население в течение веков сохранялось лишь в горных районах Крита.
Минойская цивилизация, судя по типу лиц, изображенных на фресках, создана ближневосточным, возможно семитским, народом, имеющим в целом признаки средиземноморской расы. Минойцы были среднего роста, обладали изящным строением тела, смуглой кожей, темными волосами и глазами. Вероятно, эта цивилизация была двухобщинная, химерная. В высших слоях общества роль мужчины была сведена на нет. Изображение «сильного пола» у минойцев всегда инфантильно, мужские подвиги в изобразительном искусстве не фиксировались, любые признаки мужского эротизма исключались (что существенно отличает минойскую цивилизацию от других), доминирующая роль женщин в общественной жизни более чем очевидна. Кто же строил дворцы, плавал на кораблях, отражал врагов? На этот вопрос нет надежного ответа. Можно лишь предположить, что женская «верхушка» минойцев имела характер жреческого этнократического сословия, пресекавшего все формы возвышения мужчин. Субтильные мужчины были низшим слоем жреческого сословия и несли, вероятно, функции обслуживания и страдательных ролей в жертвенных ритуалах. Некоторые исследователи предполагают ритуальный каннибализм минойцев.