Оперативная игра позволила чекистам установить конкретные факты подрывной деятельности иностранных дипломатов и дала возможность глубже проникнуть в среду заговорщиков. Однако покушение на жизнь В. И. Ленина заставило органы власти принять решение о немедленном прекращении «игры» и экстренном аресте всех установленных контрреволюционеров. 31 августа сотрудники ВЧК, нарушив нормы международного права, захватили здание английского посольства в Петрограде. Осуществлению этой акции попытался помешать морской атташе Британского посольства Кроми, убив одного из чекистов и ранив другого. Ответным огнем англичанин был убит. За захватом посольства последовали обыски и аресты среди сотрудников английской и французской дипломатических служб в Москве, а также у связанных с ними российских граждан. Часть дипломатов-заговорщиков попытались уйти через норвежское посольство, прикрываясь чужими документами. Однако советские чекисты сумели задержать главного резидента американской разведки Ксенофонта Каламатиано. Изъятые у него материалы убедительно свидетельствовали, что, прикрываясь коммерческой деятельностью, он успешно вербовал для американской разведки агентуру, способную получить информацию по широкому спектру военных, политических, экономических и социальных проблем.
Судебный процесс по делу «о заговоре Локкарта» состоялся в Москве с 28 ноября по 3 декабря 1918 года. К этому времени обстановка в стране несколько смягчилась. Обвинение было выдвинуто против 24 человек, четверых из них судили заочно, Сиднею Рейли и Генриху Вертимону удалось избежать встречи с ВЧК. Французский генеральный консул Гренар выехал на родину. После ареста Локкарта в Англии был задержан М. Литвинов, что вынудило советское правительство освободить Локкарта в обмен на освобождение Литвинова.
3 декабря 1918 года Верховный революционный трибунал признал установленной «…
Трибунал приговорил К. Каламантиано к расстрелу (впоследствии высшая мера была заменена другим наказанием), Локкарт, Гренар, Рейли и Вертимон были объявлены вне закона и подлежали расстрелу «при первом же обнаружении их в пределах территории России». 8 человек было оправдано, остальные приговорены к различным срокам заключения.
Это было одно из первых прямых столкновений советской контрразведки и иностранных разведывательных служб, победу в котором одержали не профессионалы из разведок европейских государств, а чекисты, только начинающие постигать премудрости тайной войны. Весной 1919 года обстановка в Советской России вновь обострилась. Из Эстонии начал наступление на Петроград Северный корпус под командованием белогвардейского генерала Родзянко. Одновременно в тылу советских войск участились диверсии и террористические акты. 12 июня 1919 года на фортах «Красная Горка», «Серая Лошадь» и «Обручев» вспыхнул мятеж. Восставшие требовали сдачи крепости белогвардейским войскам. Однако ни Кронштадт, ни флот не поддержали восставших, и 16 июня мятеж был подавлен. Более 15 тысяч рабочих, возглавляемые чекистами, провели массовые обыски в Северной столице. Обыскивались не только подозрительные квартиры, но и дипломатические представительства враждебных Советской России государств. В ходе обысков было изъято 7 тысяч пулеметов, винтовок, револьверов, более 140 тысяч единиц боеприпасов, значительное число драгоценностей Одновременно были получены данные о существовании в городе организации, называемой «Национальный Центр», борющейся с существующей властью. Однако нити, ведущие к руководящему звену организации, нащупать сразу не удалось.