Территория России к 1533 году составляла 280 000 квадратных километров, а к концу XVI века — 5 400 000 квадратных километров. Население России в середине XVI века составляло 6 миллионов человек. В состав Московского государства к концу XVI века входили:
• «Царственный» город Москва с ближайшими подмосковными землями; город защищали монастыри Данилов, Симонов, Новодевичий, Андроников и Донской монастыри, образованные до начала XVI века;
• Московский край с городами Можайском, Волоколамском, Серпуховом, Каширой, Коломной, Звенигородом, Рузой, Вереей, Боровском, Дмитровом, Киржачем; в крае находились монастыри-крепости Троице-Сергиевский, Пафнутиев-Боровский, Иосифо-Волоколамский, Саввино-Сторожевский и Благовещенский;
• Замоскворецкий край с городами Суздалем, Владимиром, Ростовом, Переяславлем-Залесским, Александровой слободой и Юрьевом-Польским;
• Тверская земля с городами Тверью, Торжком, Кашиным. Старицей, Микулиным, Бежецким верхом, Ржевом, Осташковым и Макариевым Калязиным монастырем;
• Заволжье с городами Угличем, Ярославлем, Костромой, Галичем, Чухломой и крупнейшим ремесленным центром по производству всевозможных изделий из металла, включая холодное и огнестрельное оружие — Устюжной Железопольской;
• Север России — Поморье, включавшее в себя Двинские земли, Белозерский край, Печерский край, Пермскую землю, Заонежье и Кольский полуостров с городами Холмогорами, Белоозером, Вологдой, Тотьмой, Великим Устюгом, Архангельском, основанным в 1583 году, Пинегой, Пустозерском, Яренском, Усть Выпью, Усть-Сысольском, Сольвычегодском, Каргополем, Кемью, Сумью, Колой и Соловецким монастырем;
• Новгородский край с городами Новгородом, Вышним Волочком, Новой и Старой Русой, Повенцем, Ладогой, Орешком, Ямом, Копорьем, Ивангородом, Корелой и Порховом;
• Псковская земля с городами Псковом, Псково-Печерским Успенским монастырем, Изборском, Островом, Опочкой, Великими Луками, Себежем и Велижем;
• Смоленская земля с городами Смоленском, Торопцом, Вязьмой, Дорогобужем и Рославлем;
• Заокские земли с городами Брянском и Калугой;
• Тульские земли с городами Тулой, Дедиловом и Донковом;
• Рязанские земли с городами Переяславлем-Рязанским, Пронском, Зарайском, Ряжском, Михайловом и Муромом;
• Северские земли с городами Путивлем, Новгородом-Северским, Рыльском и Стародубом;
• часть «Дикого поля» с городами Орлом, Ливнами, Воронежем, Ельцом, Белгородом, Осколом, Валуйками, Кромами и Курском;
• Нижнее Поволжье и часть Закамья с городами Нижним Новгородом, Балахной, Павловом, Арзамасом, Темниковом и Шацком;
• Вятская земля с городами Хлыновом-Вяткой, Слободском и Шестаковом;
• Закамские земли с городами Чердынью, Орлом-Каргеданом, Соликамском, Кийгородом и Пыскорским монастырем;
• горная сторона Волги и чувашские земли с городами Свияжском, Чебоксарами и Васильсурском;
• Казанская земля с городами Казанью, Лаишевом и Тетюшевом;
• Астраханская земля с городами Астраханью, Самарой, Саратовом и Царициным;
• Башкирские земли;
• часть земель Северного Кавказа — Кабарда.
Полный титул царя Федора Иоанновича при короновании на царство в 1584 году выглядел так:
«Божиею милостию Царь и Великий князь, Федор Иоаннович, всеа Руси самодержец. Владимирский, Московский, Новгородский, Царь Казанский, Царь Астраханский, Государь Псковский и Великий князь Смоленский, Тверский, Югорский, Пермский, Вятский, Болгарский и иных Государь и Великий князь Новгорода Низовския земли, Черниговский, Рязанский, Полоцкий, Ростовский, Ярославский, Белоозерский, Лифляндский, Удорский, Обдорский, Кондинский, и всеа Сибирския земли и северные страны повелитель и иных многих Государств Государь и обладатель».
В начале XVI века В Московском государстве были великокняжеские владения, крупные удельные княжества, земли служилых князей и бояр, монастырские земли, вотчины и поместья детей боярских и дворян. Земли делились на уезды, волости, станы и вотчины знати, сложившиеся в соответствии с удельными владениями, существовавшими на Руси. Уезды делились на волости, волости на станы, а станы на села, деревни и починки. Села, как правило, являлись центрами крупного землевладения. В селе XVI века было обычно полтора десятка дворов, в деревне — пять или шесть, в починке — четыре.
С середины XVI века старую систему государственного управления — введенных и путных бояр и «Казенный двор» — сменила приказная система.