Австрийцы дерзнули бросить вызов Наполеону, но терпели полное бедствие. Начиная кампанию во имя свободы и независимости, они уповали на свои как никогда многочисленные войска, их великолепное оснащение, хорошую подготовку солдат и их высокий боевой дух. Ни один из этих факторов не позволил им победить Наполеона — его солдаты и командиры являли чудеса героизма и самопожертвования и вновь полностью превзошли неприятеля. Союзники французов — баварцы и вюртембержцы — оказывали требуемое содействие. Однако армия Наполеона торжествовала в основном там, где император присутствовал лично. На других фронтах войны — в Тироле, в Италии, в Польше — австрийцы наступали и имели некоторый успех.
В первых сражениях с армией Наполеона австрийцы понесли огромные потери убитыми, ранеными и пленными. Они запросили перемирия, но император его отверг, планируя полный разгром вооруженных сил монархии Габсбургов.
Несмотря на очевидные затруднения в Испании и необходимость воевать и держать корпуса в разных странах Европы, Наполеон не отказался от планов мирового доминирования и своей ключевой мысли: добиться мира и спокойствия на континенте и затем нанести англичанам многочисленные удары, вытесняя их отовсюду — из Сицилии, из Африки, из Восточной и Западной Индии. Он держал Египет под прицелом, планируя новую экспедицию, и возлагал большие надежды на свои силы в Средиземном море. Гибель флота при Трафальгаре вовсе не похоронила его проекты по строительству боевых кораблей: он имел достаточно средств для их реализации и к 1809 году достиг значительного прогресса в этой области. На верфях Франции, Бельгии и Голландии были построены новые суда, которые теперь могли быть использованы в разных точках земного шара и для различных целей. Наполеон вновь и вновь возвращался к идее высадки в Англии. Были и иные угрозы, вызывавшие огромное беспокойство британцев. Французы сосредоточили боевые корабли на рейде острова Экс в районе порта Рошфор и теперь могли тревожить вражеские коммуникации с Португалией. Английская торговля была ограничена континентальной системой Наполеона, но оставалась очень активной в Вест-Индии. Военно-морской флот империи французов вновь был в силах делать то, что удавалось в 1805 году адмиралам Миссиесси и Вильнёву — атаковать британские поселения на островах Карибского бассейна, разрушать те, которыми нельзя завладеть, захватывать торговые суда.
Опасность возрастала, и в Британском адмиралтействе думали о способах защиты. Район базирования французских судов был очень неудобен для блокады, поскольку суровые условия Бискайского залива не позволяли флоту англичан занимать стабильное положение. Был разработан план атаки и уничтожения французских кораблей, дерзость которого заставила вспомнит о знаменитое нападение Фрэнсиса Дрейка на испанский порт Кадис. Выполнение операции поручили капитану лорду Томасу Кохрейну — моряку необыкновенного мужества и великому мастеру иррегулярных морских операций, хорошо рассчитанных диверсий, штурмов и абордажей.
В апреле 1809 года лорд Кохрейн атаковал французский флот, стоявший на защищенном рейде острова Экс, с помощью зажигательных судов и кораблей, начиненных бомбами. Наполеон практически не применял новейшие средства ведения войны, в то время как англичане использовали их в полной мере. Ракеты, торпеды, начиненные взрывчаткой корабли уже стали оружием массового уничтожения людей и разрушения городов, парусных судов и других объектов. Наполеон создавал новое рыцарство, в то время как век рыцарства давно миновал.
Французские моряки были совершенно деморализованы ужасающей акцией. Лорд Кохрейн нанес их флоту меньший урон, чем Нельсон в Трафальгарском сражении, но дело здесь не в количестве уничтоженных кораблей. О каком реальном соперничестве на морях можно было говорить, если англичане явно сильнее? Они дерзко смели все преграды на своем пути и заставили французов в панике метаться и сажать на мель свои корабли. Будь Кохрейн должным образом поддержан, англичане уничтожили бы весь флот. Но и учиненного разгрома было вполне достаточно, чтобы французы окончательно утратили веру в свои силы. Военный суд приговорил одного капитана к расстрелу, а двух других — к тюремному заключению. Но что могли предпринять французские адмиралы и капитаны, если их матросы тренировались только на суше или на кораблях, стоявших в гавани, в то время как англичане полностью отняли у них море и снискали право считаться непобедимыми?
На планах диверсий в Карибском бассейне поставили крест. Наполеону не суждено было создать мировую колониальную империю, а морская история событий той войны была окончена.